More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0210 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  59.19 
 
 
602 aa  711    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  100 
 
 
550 aa  1118    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.64 
 
 
579 aa  717    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.95 
 
 
551 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.72 
 
 
547 aa  542  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.71 
 
 
548 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  44.63 
 
 
316 aa  266  5e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  42.9 
 
 
304 aa  246  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  42.14 
 
 
315 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  41.81 
 
 
318 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  40.8 
 
 
321 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.8 
 
 
321 aa  240  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.8 
 
 
321 aa  240  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  40.8 
 
 
318 aa  240  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  40.8 
 
 
318 aa  240  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  40.8 
 
 
318 aa  240  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  40.8 
 
 
318 aa  240  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  46.93 
 
 
345 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  41.47 
 
 
318 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  40.13 
 
 
318 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  41.53 
 
 
318 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  39.93 
 
 
318 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  46.15 
 
 
321 aa  234  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  45.7 
 
 
321 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  44.3 
 
 
361 aa  232  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03190  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  32.34 
 
 
560 aa  232  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  44.63 
 
 
312 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  43.24 
 
 
308 aa  230  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  43.92 
 
 
320 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  42.91 
 
 
304 aa  228  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  45.7 
 
 
321 aa  226  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  41.2 
 
 
308 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  39.67 
 
 
308 aa  226  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  40.86 
 
 
304 aa  224  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  38.61 
 
 
323 aa  225  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  39.09 
 
 
340 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  39.94 
 
 
314 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  39.67 
 
 
311 aa  225  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  43.61 
 
 
321 aa  225  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  39.67 
 
 
311 aa  225  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  43.14 
 
 
320 aa  225  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  42.26 
 
 
317 aa  224  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  44.04 
 
 
327 aa  224  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  41.1 
 
 
320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  41.1 
 
 
320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  42.45 
 
 
324 aa  223  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  40.92 
 
 
312 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  40.92 
 
 
312 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  42.05 
 
 
326 aa  221  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  38.69 
 
 
310 aa  220  5e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  39.16 
 
 
316 aa  220  5e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  45.67 
 
 
325 aa  220  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  40.2 
 
 
396 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  41.69 
 
 
311 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  41.8 
 
 
324 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  45.25 
 
 
321 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01775  probable alkyl hydroperoxide reductase subunit F  32.6 
 
 
529 aa  219  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  40.67 
 
 
331 aa  219  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  42.07 
 
 
306 aa  219  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  41.61 
 
 
313 aa  218  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  39.73 
 
 
310 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  40.84 
 
 
317 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  43.34 
 
 
334 aa  218  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  38.83 
 
 
316 aa  218  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  44.37 
 
 
321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_002950  PG0619  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  35.78 
 
 
515 aa  217  4e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.633675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  40.26 
 
 
320 aa  217  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  41.1 
 
 
321 aa  217  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  43.18 
 
 
326 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  40.78 
 
 
317 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  44.01 
 
 
326 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  45 
 
 
321 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  41.14 
 
 
409 aa  215  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  40.33 
 
 
311 aa  216  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  40.61 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  41.67 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  39.1 
 
 
335 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  41.75 
 
 
318 aa  215  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  40.13 
 
 
320 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  41.67 
 
 
317 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  41.13 
 
 
362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  39.51 
 
 
324 aa  214  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  42.38 
 
 
322 aa  214  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  41.45 
 
 
313 aa  213  4.9999999999999996e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  38.24 
 
 
317 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  40.88 
 
 
309 aa  213  7e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  40.51 
 
 
324 aa  213  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1834  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  30.86 
 
 
510 aa  212  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0190333  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1499  thioredoxin reductase  42.68 
 
 
324 aa  212  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  33.26 
 
 
523 aa  213  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  42.17 
 
 
317 aa  211  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  37.97 
 
 
310 aa  211  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  40.59 
 
 
318 aa  212  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  40.19 
 
 
323 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  40.19 
 
 
323 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  43.89 
 
 
321 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  40.65 
 
 
317 aa  211  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  42.62 
 
 
323 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  40.2 
 
 
311 aa  211  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1403  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  31.93 
 
 
525 aa  211  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>