More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3874 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 548 aa  1120    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.13 
 
 		 579 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.34 
 
 		 551 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.37 
 
 		 547 aa  464  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  45.71 
 
 		 550 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.28 
 
 		 602 aa  428  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  44.3 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  44.55 
 
 		 315 aa  236  9e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  45.21 
 
 		 318 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  46.74 
 
 		 317 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  42.27 
 
 		 304 aa  230  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  46.74 
 
 		 317 aa  230  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  41.88 
 
 		 318 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  40.91 
 
 		 318 aa  227  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  40.91 
 
 		 321 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.91 
 
 		 321 aa  227  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.91 
 
 		 321 aa  227  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  40.91 
 
 		 318 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  40.91 
 
 		 318 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  40.91 
 
 		 318 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  41.23 
 
 		 318 aa  226  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  43.05 
 
 		 396 aa  226  7e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  41.56 
 
 		 318 aa  226  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  44.03 
 
 		 323 aa  225  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  42.05 
 
 		 308 aa  224  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  43.43 
 
 		 304 aa  223  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  40.47 
 
 		 340 aa  222  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  43.39 
 
 		 308 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  42.52 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  42.52 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0619  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  36.42 
 
 		 515 aa  219  7.999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.633675 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  41.02 
 
 		 318 aa  219  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  40.58 
 
 		 310 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  33.2 
 
 		 523 aa  217  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  42.28 
 
 		 310 aa  217  5e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  43.05 
 
 		 310 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01775  probable alkyl hydroperoxide reductase subunit F  33.06 
 
 		 529 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  45.05 
 
 		 312 aa  216  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  42.02 
 
 		 320 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4221  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.09 
 
 		 529 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.054716 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  42.57 
 
 		 409 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  44.04 
 
 		 321 aa  211  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  44.04 
 
 		 327 aa  211  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03190  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  29.87 
 
 		 560 aa  210  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  41.69 
 
 		 343 aa  210  4e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  41.36 
 
 		 310 aa  210  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  40.53 
 
 		 312 aa  209  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  40.53 
 
 		 312 aa  209  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.45 
 
 		 509 aa  209  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0618  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  31.51 
 
 		 520 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.309291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  39.48 
 
 		 319 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  39.26 
 
 		 308 aa  208  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  43.88 
 
 		 306 aa  208  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.59 
 
 		 521 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  38.98 
 
 		 334 aa  206  6e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  40.33 
 
 		 304 aa  206  9e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  40.92 
 
 		 321 aa  206  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  42.03 
 
 		 326 aa  205  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  39.53 
 
 		 311 aa  205  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0047  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  32.37 
 
 		 512 aa  205  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  39 
 
 		 323 aa  204  3e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  43.38 
 
 		 320 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  40.68 
 
 		 332 aa  203  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  39.12 
 
 		 310 aa  204  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1834  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  30.17 
 
 		 510 aa  203  6e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0190333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  43.3 
 
 		 316 aa  203  7e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  40.14 
 
 		 306 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.87 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  39.24 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  42.23 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  41.64 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2811  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  34.34 
 
 		 538 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000304525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  41.96 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 324 aa  201  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  40.91 
 
 		 309 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  39.94 
 
 		 331 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  41.14 
 
 		 306 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  41.25 
 
 		 321 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  40.14 
 
 		 306 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  40.54 
 
 		 322 aa  200  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  40.82 
 
 		 330 aa  200  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  42.09 
 
 		 307 aa  200  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  40.59 
 
 		 321 aa  200  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0709  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.26 
 
 		 314 aa  200  6e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  40.89 
 
 		 317 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1927  alkyl hydroperoxide reductase subunit  34.7 
 
 		 601 aa  199  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.586969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1067  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.14 
 
 		 535 aa  199  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  41.28 
 
 		 340 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1196  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.9 
 
 		 518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000420739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  39.38 
 
 		 332 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  44.71 
 
 		 318 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2974  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.02 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250232  normal  0.0117128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  38.64 
 
 		 330 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0943  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  31.88 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0354  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.81 
 
 		 515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  39.69 
 
 		 333 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  42.42 
 
 		 321 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  39.53 
 
 		 308 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0929  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  32.95 
 
 		 522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  38.21 
 
 		 306 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>