More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0223 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  100 
 
 
323 aa  650    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0632  thioredoxin reductase (NADPH)  71.43 
 
 
323 aa  480  1e-134  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00998267  normal  0.636604 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
343 aa  315  6e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0559  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.21 
 
 
328 aa  292  6e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.239384  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  43.23 
 
 
306 aa  237  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  41.83 
 
 
304 aa  237  3e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  42.02 
 
 
396 aa  236  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  42.76 
 
 
312 aa  236  3e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  42.57 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  40.45 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  41.83 
 
 
308 aa  233  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  41.56 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  43.56 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  41.45 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  41.18 
 
 
304 aa  227  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  41.72 
 
 
311 aa  226  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0776  thioredoxin-disulfide reductase  43 
 
 
321 aa  225  8e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.624753  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  41.97 
 
 
320 aa  225  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  40.52 
 
 
332 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  40.27 
 
 
304 aa  222  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  41.08 
 
 
323 aa  222  7e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0626  thioredoxin-disulfide reductase  40.72 
 
 
320 aa  222  8e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1704  thioredoxin-disulfide reductase  41.04 
 
 
321 aa  219  5e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.473306  normal  0.0188738 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  41.69 
 
 
313 aa  218  1e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  39.34 
 
 
304 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  40.78 
 
 
315 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  40.72 
 
 
310 aa  215  7e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  39.81 
 
 
321 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  39.81 
 
 
321 aa  215  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  39.81 
 
 
321 aa  215  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  40.2 
 
 
318 aa  215  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  40.2 
 
 
318 aa  215  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  40.2 
 
 
318 aa  215  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  40.2 
 
 
318 aa  215  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  39.67 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  37.91 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  42.76 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  40.66 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  40.2 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  38.03 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0040  glucose-inhibited division protein A  41.61 
 
 
340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.390106  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  39.29 
 
 
310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  39.67 
 
 
318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  39.54 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  39.54 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  37.79 
 
 
383 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  40.45 
 
 
310 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  40.46 
 
 
384 aa  210  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  38.69 
 
 
330 aa  210  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  36.71 
 
 
340 aa  210  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.76 
 
 
321 aa  209  4e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  37.79 
 
 
335 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  40.32 
 
 
318 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  37.66 
 
 
313 aa  208  8e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  39.3 
 
 
317 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  39.3 
 
 
317 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  38.51 
 
 
306 aa  207  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  39.27 
 
 
311 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  39.27 
 
 
311 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  39.48 
 
 
308 aa  206  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  38.59 
 
 
395 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  41.31 
 
 
320 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  38.02 
 
 
309 aa  205  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.66 
 
 
579 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  36.51 
 
 
317 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  38.76 
 
 
316 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39 
 
 
548 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  41.75 
 
 
308 aa  204  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  36.09 
 
 
339 aa  204  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  36.51 
 
 
312 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  38.49 
 
 
311 aa  204  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  40.13 
 
 
311 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  37.42 
 
 
359 aa  203  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  41.5 
 
 
325 aa  202  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0579  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.91 
 
 
325 aa  202  5e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  39.61 
 
 
309 aa  202  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  39.61 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  36.81 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  37.38 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0709  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.42 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  37.25 
 
 
402 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  40.13 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  36.81 
 
 
312 aa  198  7.999999999999999e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0603  thioredoxin reductase  38.49 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00896552  hitchhiker  0.000000000102753 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  39.05 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  37.58 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  37.42 
 
 
312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  37.42 
 
 
312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  40.97 
 
 
391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  38.56 
 
 
318 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  37.42 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.46 
 
 
555 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  37.25 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  38.11 
 
 
319 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  37.42 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  37.74 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  35.71 
 
 
523 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  37.99 
 
 
319 aa  196  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0214  thioredoxin-disulfide reductase  38.34 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.136255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  34.56 
 
 
337 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.65514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>