More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0559 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0559  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
328 aa  665    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.239384  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  64.56 
 
 
343 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  48.21 
 
 
323 aa  331  1e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0632  thioredoxin reductase (NADPH)  50.33 
 
 
323 aa  311  7.999999999999999e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00998267  normal  0.636604 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  41.69 
 
 
312 aa  243  3e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  39.68 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  39.54 
 
 
306 aa  233  3e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  41.27 
 
 
323 aa  231  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  42.76 
 
 
402 aa  229  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  40 
 
 
318 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  42.9 
 
 
306 aa  228  8e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  37.74 
 
 
318 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  37.74 
 
 
321 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  37.74 
 
 
321 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  37.74 
 
 
321 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  37.74 
 
 
318 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  37.74 
 
 
318 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  37.74 
 
 
318 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  42.95 
 
 
308 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  38.06 
 
 
318 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  39.03 
 
 
318 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  41.84 
 
 
306 aa  227  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  39.22 
 
 
304 aa  226  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  37.3 
 
 
318 aa  225  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  37.42 
 
 
409 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  37.74 
 
 
318 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  42.05 
 
 
317 aa  222  7e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.97 
 
 
579 aa  222  9e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  40.26 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  38.36 
 
 
340 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  38.24 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  41.95 
 
 
317 aa  220  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  38.61 
 
 
304 aa  220  3e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  42.24 
 
 
326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.47 
 
 
548 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  38.36 
 
 
311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  37.46 
 
 
311 aa  216  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  40 
 
 
309 aa  215  8e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  39.74 
 
 
311 aa  215  8e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  40.51 
 
 
383 aa  215  9e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  40.2 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  41.18 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0626  thioredoxin-disulfide reductase  38.69 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  39.6 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  38.82 
 
 
316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  38.49 
 
 
396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1704  thioredoxin-disulfide reductase  39.67 
 
 
321 aa  212  7e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.473306  normal  0.0188738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  36.84 
 
 
334 aa  211  1e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.46 
 
 
316 aa  211  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  38.54 
 
 
312 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.7 
 
 
321 aa  210  2e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0214  thioredoxin-disulfide reductase  39.74 
 
 
312 aa  210  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.136255  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  38.24 
 
 
310 aa  210  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  37.29 
 
 
302 aa  209  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  37.1 
 
 
310 aa  209  6e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  37.95 
 
 
306 aa  208  9e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  39.29 
 
 
334 aa  208  9e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.13 
 
 
551 aa  208  9e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  37.95 
 
 
306 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0776  thioredoxin-disulfide reductase  37.7 
 
 
321 aa  207  3e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.624753  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  38.92 
 
 
384 aa  206  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  38.8 
 
 
395 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  39.16 
 
 
312 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  39.16 
 
 
317 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  39.16 
 
 
313 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  38.11 
 
 
550 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.53 
 
 
509 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0040  glucose-inhibited division protein A  40.66 
 
 
340 aa  202  4e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.390106  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  33.77 
 
 
310 aa  202  6e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  37.22 
 
 
333 aa  201  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  34.42 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  40.91 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  34.42 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  38.44 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  37.7 
 
 
345 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  35.95 
 
 
308 aa  199  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  38.21 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.81 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  37.3 
 
 
523 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  39.93 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1411  thioredoxin reductase  39.37 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0579  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.89 
 
 
325 aa  197  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  38.03 
 
 
324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0709  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.86 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  35.95 
 
 
317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  37.99 
 
 
322 aa  196  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.05 
 
 
427 aa  196  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.7 
 
 
306 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  40.47 
 
 
306 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  36.86 
 
 
330 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1834  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  35.31 
 
 
510 aa  195  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0190333  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  36.22 
 
 
332 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  36.36 
 
 
312 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  36.36 
 
 
312 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  36.25 
 
 
335 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  40.98 
 
 
321 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  37.05 
 
 
323 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  36.31 
 
 
317 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  38.16 
 
 
332 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  40.66 
 
 
327 aa  192  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>