More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0632 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0632  thioredoxin reductase (NADPH)  100 
 
 		 323 aa  658    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00998267  normal  0.636604 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  71.43 
 
 		 323 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  50.65 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0559  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.33 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.239384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  40.65 
 
 		 409 aa  235  7e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  39.23 
 
 		 312 aa  232  5e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  41.83 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  39.87 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  40.97 
 
 		 310 aa  225  7e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  40.98 
 
 		 306 aa  225  8e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  39.8 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  39.47 
 
 		 306 aa  222  7e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  42.76 
 
 		 320 aa  222  8e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  40.46 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  38.82 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  40.48 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  40.39 
 
 		 311 aa  219  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  37.58 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  38.96 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  39.41 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  42.05 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  37.7 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  40.65 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  39.41 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  38.69 
 
 		 302 aa  216  5.9999999999999996e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  37.01 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  38.31 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  36.09 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0603  thioredoxin reductase  39.8 
 
 		 309 aa  212  7e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00896552  hitchhiker  0.000000000102753 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  39.22 
 
 		 335 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  38.39 
 
 		 340 aa  212  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  43.18 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  38.83 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  37.97 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  37.35 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  39.02 
 
 		 330 aa  209  6e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  38.61 
 
 		 317 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  39.14 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  38.61 
 
 		 312 aa  208  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  39.81 
 
 		 310 aa  208  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2898  thioredoxin reductase (NADPH)  38.66 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611748  hitchhiker  0.00113285 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  38.72 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  39.05 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  40.35 
 
 		 344 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  37.79 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0040  glucose-inhibited division protein A  40.45 
 
 		 340 aa  206  3e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.390106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  38.61 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  39.47 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  38.76 
 
 		 332 aa  206  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1704  thioredoxin-disulfide reductase  38.83 
 
 		 321 aa  205  7e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.473306  normal  0.0188738 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  37.79 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  38.44 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  38.76 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  38.24 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  37.58 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  36.74 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  36.74 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  36.74 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  36.48 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  36.71 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  37.58 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  37.58 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  36.22 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  39.35 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  37.58 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  36.93 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.22 
 
 		 555 aa  203  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  36.93 
 
 		 318 aa  203  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  36.93 
 
 		 318 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  36.24 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0626  thioredoxin-disulfide reductase  37.66 
 
 		 320 aa  202  4e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  37.91 
 
 		 335 aa  202  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  35.76 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  38.82 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0776  thioredoxin-disulfide reductase  37.66 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.624753  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0579  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.98 
 
 		 325 aa  202  9e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1834  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  35.22 
 
 		 510 aa  202  9e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0190333  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  37.42 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  37.95 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  36.6 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  37.95 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  36.6 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  40.38 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  37.01 
 
 		 359 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  38.51 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  41.45 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  35.86 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  40.52 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  37.83 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  42.11 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.64 
 
 		 579 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  35.83 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  38.94 
 
 		 319 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0709  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.09 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  37.38 
 
 		 316 aa  199  7.999999999999999e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  34.92 
 
 		 311 aa  198  7.999999999999999e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  36.77 
 
 		 334 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  37.66 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  38.16 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01260  thioredoxin-disulfide reductase, putative  35.76 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>