More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0626 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0626  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 		 320 aa  645    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0776  thioredoxin-disulfide reductase  90.94 
 
 		 321 aa  608  1e-173  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.624753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  90.31 
 
 		 321 aa  608  1e-173  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1704  thioredoxin-disulfide reductase  87.19 
 
 		 321 aa  594  1e-169  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.473306  normal  0.0188738 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0040  glucose-inhibited division protein A  57.19 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.390106  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0579  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.16 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  40.72 
 
 		 323 aa  222  8e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 346 aa  221  9e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  40.98 
 
 		 304 aa  219  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  40.66 
 
 		 330 aa  218  7.999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  43.85 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  39.06 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  42.3 
 
 		 306 aa  215  8e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  39.22 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  39.16 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  37.79 
 
 		 353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  37.3 
 
 		 359 aa  212  5.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  40 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  41.06 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  40.4 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  40 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  40 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  40.33 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  37.91 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  40.78 
 
 		 312 aa  209  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  39.53 
 
 		 313 aa  209  6e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  40.52 
 
 		 319 aa  208  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  39.87 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  39.6 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  39.54 
 
 		 310 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  41.28 
 
 		 320 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  39.09 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  40.51 
 
 		 318 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  39.46 
 
 		 311 aa  203  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  37.13 
 
 		 409 aa  203  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  40.19 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  43 
 
 		 325 aa  202  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  38.49 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  36.67 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  39.02 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  37.09 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  37.21 
 
 		 384 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  36.66 
 
 		 343 aa  198  7.999999999999999e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  36.67 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  37.79 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  37.13 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  38.21 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  37.79 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  36.84 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  39.6 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  36.79 
 
 		 391 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  37.71 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  42.48 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  39.26 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  38.33 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  38.82 
 
 		 340 aa  195  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 329 aa  195  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  42.21 
 
 		 321 aa  195  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  41.61 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 309 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.64 
 
 		 555 aa  194  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  38.49 
 
 		 317 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  37.54 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  38.24 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  38.87 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  34.75 
 
 		 523 aa  193  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  42.3 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  37.75 
 
 		 311 aa  193  4e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  36.09 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  38.76 
 
 		 348 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  37.34 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  36.6 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01775  probable alkyl hydroperoxide reductase subunit F  35.86 
 
 		 529 aa  192  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  37.79 
 
 		 310 aa  192  8e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  34.49 
 
 		 569 aa  192  9e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  39.36 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  38.21 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  36.88 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  36.88 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  38.94 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3179  thioredoxin reductase  37.34 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  35.33 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  38.76 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  37.21 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  37.13 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  35.08 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  38.82 
 
 		 329 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  38.19 
 
 		 555 aa  189  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  37.62 
 
 		 304 aa  188  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  35.69 
 
 		 442 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  36.81 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  37.29 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  34.29 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  36.63 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  35.92 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  34 
 
 		 383 aa  186  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  37.71 
 
 		 316 aa  186  6e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  35.56 
 
 		 323 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  38.89 
 
 		 348 aa  186  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>