More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1704 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1704  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
321 aa  649    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.473306  normal  0.0188738 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0626  thioredoxin-disulfide reductase  87.19 
 
 
320 aa  594  1e-169  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0776  thioredoxin-disulfide reductase  86.92 
 
 
321 aa  588  1e-167  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.624753  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  84.42 
 
 
321 aa  580  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0040  glucose-inhibited division protein A  54.31 
 
 
340 aa  352  5e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.390106  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0579  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.63 
 
 
325 aa  305  7e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  41.04 
 
 
323 aa  219  5e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  40.86 
 
 
346 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  43.85 
 
 
326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  41.31 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  39.16 
 
 
340 aa  212  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  38.64 
 
 
402 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  40.98 
 
 
306 aa  210  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  38.69 
 
 
330 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  39.2 
 
 
384 aa  208  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  38.41 
 
 
395 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  38.89 
 
 
333 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  38.89 
 
 
333 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  38.89 
 
 
333 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  37.83 
 
 
336 aa  205  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  41.16 
 
 
318 aa  205  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  37.54 
 
 
359 aa  205  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  40.84 
 
 
315 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  39.53 
 
 
313 aa  204  2e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  37.29 
 
 
331 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  37.74 
 
 
353 aa  203  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  39.8 
 
 
391 aa  203  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  38.66 
 
 
312 aa  203  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  37.25 
 
 
313 aa  202  7e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  37.17 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  38.89 
 
 
310 aa  200  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  38.89 
 
 
319 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  38.91 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  38.11 
 
 
332 aa  199  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  36.33 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  36.75 
 
 
409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  38.11 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  38.49 
 
 
318 aa  196  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  37.17 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  39.33 
 
 
330 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  37.42 
 
 
311 aa  196  6e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  36.75 
 
 
333 aa  196  6e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  36.33 
 
 
306 aa  195  7e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  41.83 
 
 
309 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  37.82 
 
 
343 aa  195  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  37.79 
 
 
311 aa  194  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  38.93 
 
 
320 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  39.8 
 
 
329 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  39.26 
 
 
317 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  37.83 
 
 
344 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  38.93 
 
 
317 aa  193  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  36.21 
 
 
330 aa  193  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  40.53 
 
 
308 aa  193  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  37.3 
 
 
306 aa  192  6e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  39.93 
 
 
329 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  38.69 
 
 
312 aa  192  9e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  36 
 
 
306 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  38.94 
 
 
340 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  37.12 
 
 
311 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01775  probable alkyl hydroperoxide reductase subunit F  36.18 
 
 
529 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  40 
 
 
321 aa  189  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  36.54 
 
 
313 aa  189  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.33 
 
 
555 aa  189  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  34.73 
 
 
547 aa  189  5.999999999999999e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  36.31 
 
 
308 aa  189  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  40.53 
 
 
325 aa  189  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  33.86 
 
 
569 aa  189  7e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  37.87 
 
 
335 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  35.88 
 
 
310 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  37.29 
 
 
331 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  40.19 
 
 
327 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0632  thioredoxin reductase (NADPH)  38.83 
 
 
323 aa  188  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00998267  normal  0.636604 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  36.21 
 
 
312 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3179  thioredoxin reductase  37.66 
 
 
316 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  36.84 
 
 
308 aa  187  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  35.9 
 
 
318 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  36.21 
 
 
317 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  39.47 
 
 
310 aa  187  3e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  38.61 
 
 
325 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  34.44 
 
 
334 aa  186  4e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  38.11 
 
 
348 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  35 
 
 
383 aa  186  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  37.92 
 
 
318 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  36.16 
 
 
310 aa  186  5e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  37.94 
 
 
332 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  37.22 
 
 
555 aa  186  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  37.01 
 
 
318 aa  185  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  36.84 
 
 
317 aa  185  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  37.94 
 
 
310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  41.46 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  38.89 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  37.94 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  35.28 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  35.76 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0666  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  34.95 
 
 
535 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0756  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  34.95 
 
 
535 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  38.93 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  38.06 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.77 
 
 
521 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  37.63 
 
 
316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>