More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3218 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  100 
 
 
395 aa  796    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  40.46 
 
 
402 aa  265  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  38.07 
 
 
391 aa  264  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  37.31 
 
 
384 aa  262  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.58 
 
 
326 aa  258  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0649931  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0709  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.25 
 
 
314 aa  247  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  35.05 
 
 
383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  43 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1834  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  37.66 
 
 
510 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0190333  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39 
 
 
509 aa  226  7e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0439  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  39 
 
 
507 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00965821  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0428  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  39 
 
 
507 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.273089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3018  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.57 
 
 
531 aa  219  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.531369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3037  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.57 
 
 
531 aa  219  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0658  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  38.57 
 
 
531 aa  219  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0520  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  38.57 
 
 
531 aa  219  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0692  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  38.57 
 
 
531 aa  219  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.766507  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0627  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  38.57 
 
 
531 aa  219  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00575  alkyl hydroperoxide reductase, F52a subunit, FAD/NAD(P)-binding  38.57 
 
 
521 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00564  hypothetical protein  38.57 
 
 
521 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0627  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  38.57 
 
 
531 aa  219  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  38.87 
 
 
304 aa  219  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01775  probable alkyl hydroperoxide reductase subunit F  36.48 
 
 
529 aa  219  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  39.54 
 
 
310 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3453  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.66 
 
 
522 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455545  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0845  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.71 
 
 
312 aa  215  9e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0059  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  37.67 
 
 
507 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.492285  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03190  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  39.34 
 
 
560 aa  215  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5402  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  41.06 
 
 
530 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000100097  normal  0.196114 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1206  AhpF  41.06 
 
 
530 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001914  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3926  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.66 
 
 
520 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0040  glucose-inhibited division protein A  41.58 
 
 
340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.390106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1146  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.45 
 
 
521 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.337025 
 
 
-
 
NC_002950  PG0619  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.05 
 
 
515 aa  213  3.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.633675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3729  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.66 
 
 
520 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  37.83 
 
 
523 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3011  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.62 
 
 
531 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0626  thioredoxin-disulfide reductase  37.91 
 
 
320 aa  211  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0776  thioredoxin-disulfide reductase  37.38 
 
 
321 aa  210  3e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.624753  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  37.8 
 
 
343 aa  209  6e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1814  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  35.19 
 
 
523 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  35.62 
 
 
310 aa  209  7e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3573  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.14 
 
 
520 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.158044  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.41 
 
 
321 aa  208  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1704  thioredoxin-disulfide reductase  38.41 
 
 
321 aa  207  2e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.473306  normal  0.0188738 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2074  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.96 
 
 
525 aa  207  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.113135 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.49 
 
 
533 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63016  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.29 
 
 
521 aa  206  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  36.75 
 
 
308 aa  206  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4090  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.49 
 
 
533 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  38.59 
 
 
323 aa  206  5e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3433  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.49 
 
 
533 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  39.74 
 
 
320 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1535  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.18 
 
 
526 aa  206  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000673423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2999  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.86 
 
 
525 aa  206  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.336504  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3656  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  39.74 
 
 
530 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425396  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3983  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.49 
 
 
532 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170234  normal  0.309156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1795  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  36.68 
 
 
525 aa  205  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114206  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3612  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.67 
 
 
519 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3500  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.49 
 
 
532 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393361  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.66 
 
 
532 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3045  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.83 
 
 
523 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  37.09 
 
 
306 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.38 
 
 
526 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0449918  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0793  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.82 
 
 
521 aa  204  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.599853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4879  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  36.07 
 
 
529 aa  203  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II, active site  36.2 
 
 
519 aa  203  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0766  thioredoxin reductase  37.29 
 
 
304 aa  203  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0341299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2924  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase class-II  38.4 
 
 
520 aa  203  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4221  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.48 
 
 
529 aa  203  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.054716 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2094  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.79 
 
 
523 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1376  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.38 
 
 
522 aa  202  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1954  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.83 
 
 
532 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0428675  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  36.75 
 
 
306 aa  202  8e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4496  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.16 
 
 
532 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783992  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0929  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  39.93 
 
 
522 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  36.09 
 
 
308 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0632  thioredoxin reductase (NADPH)  42.05 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00998267  normal  0.636604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5071  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.15 
 
 
518 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.132309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  37.99 
 
 
334 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0047  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  36.18 
 
 
512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2518  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  39.07 
 
 
509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  38.74 
 
 
302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  36.42 
 
 
306 aa  200  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0830  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.52 
 
 
522 aa  201  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  34.77 
 
 
304 aa  199  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1403  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.08 
 
 
525 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0618  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  40.46 
 
 
520 aa  200  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.309291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01720  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  38.29 
 
 
521 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.452845 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2440  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.62 
 
 
520 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3255  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  38.62 
 
 
520 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3186  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  38.73 
 
 
520 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1067  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.74 
 
 
535 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1243  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  36.93 
 
 
517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1196  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.61 
 
 
518 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000420739  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.93 
 
 
520 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.663768  normal  0.219895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3533  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  35.97 
 
 
520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.463079  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0943  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  35.91 
 
 
509 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  37.75 
 
 
315 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1417  thioredoxin-disulfide reductase  40 
 
 
526 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>