More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3533 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00575  alkyl hydroperoxide reductase, F52a subunit, FAD/NAD(P)-binding  64.29 
 
 		 521 aa  686    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3018  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  64.29 
 
 		 531 aa  686    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.531369  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4879  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  72.92 
 
 		 529 aa  738    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0520  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  64.29 
 
 		 531 aa  686    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0870  subunit F of alkyl hydroperoxide reductase  69.5 
 
 		 531 aa  719    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.037495  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2440  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  97.5 
 
 		 520 aa  996    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001043  alkyl hydroperoxide reductase protein F  63.2 
 
 		 522 aa  650    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.30284  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00564  hypothetical protein  64.29 
 
 		 521 aa  686    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3573  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  66.35 
 
 		 520 aa  687    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.158044  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04590  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  74.66 
 
 		 530 aa  755    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5402  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  73.75 
 
 		 530 aa  755    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000100097  normal  0.196114 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0246  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  71.18 
 
 		 524 aa  736    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0118696  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0217  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  81.35 
 
 		 521 aa  845    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  72.12 
 
 		 521 aa  755    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4716  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.08 
 
 		 523 aa  650    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1403  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  67.7 
 
 		 525 aa  704    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3453  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.98 
 
 		 522 aa  691    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455545  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0956  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  64.41 
 
 		 527 aa  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3107  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  80.58 
 
 		 520 aa  842    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00119955  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  64.62 
 
 		 523 aa  691    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0354  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.29 
 
 		 515 aa  640    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2999  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  67.5 
 
 		 525 aa  733    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.336504  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04761  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  63.01 
 
 		 522 aa  650    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  70.69 
 
 		 532 aa  733    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26320  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  76.2 
 
 		 521 aa  784    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.41 
 
 		 523 aa  670    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653172  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0756  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  71.46 
 
 		 535 aa  727    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2974  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  81.15 
 
 		 520 aa  846    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250232  normal  0.0117128 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2368  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  70.46 
 
 		 518 aa  702    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0331686  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1376  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  70.5 
 
 		 522 aa  730    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3518  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II, active site  70.25 
 
 		 521 aa  714    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.401893  hitchhiker  0.00190824 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4496  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  73.41 
 
 		 532 aa  763    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2094  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  78.31 
 
 		 523 aa  807    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3942  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  69.63 
 
 		 524 aa  718    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  0.781405 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2044  alkyl hydroperoxide reductase subunit  71.46 
 
 		 622 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2924  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase class-II  86.35 
 
 		 520 aa  890    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1091  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.99 
 
 		 535 aa  677    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0658  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  64.29 
 
 		 531 aa  686    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1954  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  72.48 
 
 		 532 aa  754    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0428675  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3533  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  100 
 
 		 520 aa  1051    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.463079  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1243  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.95 
 
 		 517 aa  639    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3926  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  65.96 
 
 		 520 aa  680    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3729  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  66.92 
 
 		 520 aa  687    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1535  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  68.67 
 
 		 526 aa  714    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000673423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1814  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  70.25 
 
 		 523 aa  726    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1417  thioredoxin-disulfide reductase  74.81 
 
 		 526 aa  771    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3983  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  72.25 
 
 		 532 aa  758    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170234  normal  0.309156 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1927  alkyl hydroperoxide reductase subunit  71.21 
 
 		 601 aa  734    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.586969  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1146  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.09 
 
 		 521 aa  668    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.337025 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II, active site  71.46 
 
 		 519 aa  734    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3639  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  65.57 
 
 		 528 aa  677    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3445  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  65.18 
 
 		 528 aa  675    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0830  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.55 
 
 		 522 aa  660    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2811  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  61.48 
 
 		 538 aa  642    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000304525 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0259  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  68.59 
 
 		 527 aa  689    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00384538 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1196  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  72.34 
 
 		 518 aa  745    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000420739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3045  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  70.17 
 
 		 523 aa  723    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0793  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.81 
 
 		 521 aa  666    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.599853 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1206  AhpF  73.69 
 
 		 530 aa  752    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3011  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.23 
 
 		 531 aa  661    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4221  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  73.61 
 
 		 529 aa  768    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.054716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1324  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  79.54 
 
 		 518 aa  808    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0640975  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  72.78 
 
 		 520 aa  739    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.663768  normal  0.219895 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0688  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  74.85 
 
 		 530 aa  768    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242332  normal  0.621191 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  72.29 
 
 		 533 aa  753    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63016  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3518  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  65.57 
 
 		 528 aa  678    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0747  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.08 
 
 		 524 aa  657    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.501154  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1067  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.4 
 
 		 535 aa  640    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2881  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  70.27 
 
 		 518 aa  701    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00897132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3255  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  97.12 
 
 		 520 aa  994    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0800  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.6 
 
 		 525 aa  671    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3223  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.41 
 
 		 525 aa  669    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.83 
 
 		 521 aa  667    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0782  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  69.69 
 
 		 531 aa  723    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0983751  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3500  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  72.67 
 
 		 532 aa  756    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01720  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  81.54 
 
 		 521 aa  846    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.452845 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3037  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  64.29 
 
 		 531 aa  686    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4055  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  69.63 
 
 		 524 aa  718    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5071  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  70.79 
 
 		 518 aa  724    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3186  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  96.92 
 
 		 520 aa  994    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0627  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  64.29 
 
 		 531 aa  686    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3433  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  71.89 
 
 		 533 aa  755    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0929  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  65.13 
 
 		 522 aa  665    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0666  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  71.46 
 
 		 535 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4090  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  72.29 
 
 		 533 aa  753    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0627  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  64.29 
 
 		 531 aa  686    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3612  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  73.46 
 
 		 519 aa  744    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0692  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  64.29 
 
 		 531 aa  686    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.766507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3326  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.6 
 
 		 525 aa  670    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0848  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.99 
 
 		 528 aa  676    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3656  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  73.94 
 
 		 530 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425396  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0618  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  64.86 
 
 		 520 aa  663    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.309291 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03190  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  59.55 
 
 		 560 aa  634  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.53 
 
 		 509 aa  610  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2518  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  60.19 
 
 		 509 aa  604  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0391  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  60.08 
 
 		 508 aa  598  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0943  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  60.19 
 
 		 509 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0448  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  59.88 
 
 		 509 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4927  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  59.88 
 
 		 508 aa  597  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0438  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  59.88 
 
 		 508 aa  594  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>