More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2437 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  85.84 
 
 
459 aa  756    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  100 
 
 
442 aa  889    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2414  thioredoxin reductase  78.03 
 
 
348 aa  556  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0323  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  74.86 
 
 
356 aa  525  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0634071 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2076  Thioredoxin-disulfide reductase  74.09 
 
 
350 aa  508  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.314276  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4219  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.47 
 
 
346 aa  375  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3641  Thioredoxin-disulfide reductase  55.09 
 
 
357 aa  360  2e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  52.54 
 
 
319 aa  323  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  49.41 
 
 
334 aa  300  4e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  49.39 
 
 
311 aa  288  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  48.15 
 
 
314 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  48.15 
 
 
314 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  49.7 
 
 
320 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  46.91 
 
 
311 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  45.59 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  46.65 
 
 
325 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  46.6 
 
 
321 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  46.3 
 
 
321 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  45.85 
 
 
321 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  45.62 
 
 
323 aa  279  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  46.32 
 
 
321 aa  279  7e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  46.32 
 
 
321 aa  279  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  46.32 
 
 
321 aa  279  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  46.32 
 
 
321 aa  279  7e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  46.32 
 
 
321 aa  279  7e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  46.32 
 
 
321 aa  279  7e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  46.32 
 
 
321 aa  279  7e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  46.48 
 
 
320 aa  279  8e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  46.48 
 
 
320 aa  279  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  46.48 
 
 
320 aa  279  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  46.32 
 
 
321 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  47.38 
 
 
318 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  45.4 
 
 
317 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  45.67 
 
 
322 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  45.67 
 
 
322 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  45.67 
 
 
322 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  45.67 
 
 
322 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  45.67 
 
 
322 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  46.59 
 
 
326 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  46.01 
 
 
321 aa  276  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  46.46 
 
 
322 aa  276  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  44.74 
 
 
319 aa  276  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  44.58 
 
 
320 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  44.58 
 
 
320 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  44.58 
 
 
320 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  44.58 
 
 
320 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  44.48 
 
 
320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  44.65 
 
 
320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  47.62 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  45.59 
 
 
313 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  47.62 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  45.76 
 
 
316 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  47.62 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1412  thioredoxin reductase  45.76 
 
 
322 aa  274  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00718409  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  46.2 
 
 
359 aa  274  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  44.95 
 
 
316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  46.79 
 
 
311 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  44.11 
 
 
320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  45.43 
 
 
318 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  47.66 
 
 
336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  44.85 
 
 
318 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  45.29 
 
 
316 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  45.65 
 
 
321 aa  273  5.000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  44.65 
 
 
316 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  46.48 
 
 
311 aa  272  7e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  44.34 
 
 
320 aa  272  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  45.73 
 
 
315 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  44.41 
 
 
318 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  45.87 
 
 
317 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  44.65 
 
 
316 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  46.32 
 
 
311 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  46.97 
 
 
325 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  44.55 
 
 
320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  48.31 
 
 
313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  47.53 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  44.68 
 
 
316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  44.55 
 
 
320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  44.54 
 
 
324 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  44.48 
 
 
337 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  45.85 
 
 
314 aa  270  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  45.45 
 
 
316 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  45.23 
 
 
323 aa  270  5e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  44.35 
 
 
324 aa  270  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  44.51 
 
 
318 aa  270  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  45.24 
 
 
320 aa  270  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  44.28 
 
 
320 aa  269  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  45.29 
 
 
324 aa  269  7e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  44.24 
 
 
319 aa  269  8e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  44.34 
 
 
311 aa  269  8e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  44.14 
 
 
342 aa  268  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  43.95 
 
 
324 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  45.9 
 
 
320 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  45.99 
 
 
321 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  45.43 
 
 
314 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  46.04 
 
 
320 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  44.34 
 
 
316 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  44.48 
 
 
317 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  47.84 
 
 
314 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  44.71 
 
 
328 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  46.2 
 
 
317 aa  268  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>