More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2414 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2414  thioredoxin reductase  100 
 
 
348 aa  698    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  78.03 
 
 
442 aa  556  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  81.4 
 
 
459 aa  544  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0323  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  75.71 
 
 
356 aa  525  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0634071 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2076  Thioredoxin-disulfide reductase  71.51 
 
 
350 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.314276  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4219  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.07 
 
 
346 aa  363  3e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3641  Thioredoxin-disulfide reductase  54.91 
 
 
357 aa  355  5e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  51.23 
 
 
319 aa  324  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  46.32 
 
 
317 aa  290  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  47.22 
 
 
314 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  47.22 
 
 
314 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  50.31 
 
 
311 aa  288  8e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  49.38 
 
 
336 aa  288  9e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  48.32 
 
 
318 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  48.2 
 
 
331 aa  286  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  46.79 
 
 
320 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  46.79 
 
 
320 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  46.79 
 
 
320 aa  285  8e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  46.79 
 
 
319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  45.62 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  45.62 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  45.51 
 
 
322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  47.29 
 
 
320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  45.62 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  45.62 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  45.62 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  45.62 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  45.51 
 
 
322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  45.62 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  45.51 
 
 
322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  45.62 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  48.46 
 
 
334 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  45.21 
 
 
322 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  45.21 
 
 
322 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  47.38 
 
 
330 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  45.32 
 
 
321 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  46.99 
 
 
320 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  45.09 
 
 
314 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  46.15 
 
 
322 aa  280  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  46.99 
 
 
320 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  46.99 
 
 
320 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  46.99 
 
 
320 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1412  thioredoxin reductase  45.18 
 
 
322 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00718409  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  44.65 
 
 
317 aa  279  6e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  45.32 
 
 
323 aa  278  8e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  45.21 
 
 
320 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  47.38 
 
 
311 aa  278  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  43.67 
 
 
319 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  47.94 
 
 
320 aa  278  1e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  44.38 
 
 
320 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  46.53 
 
 
320 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  45.92 
 
 
311 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  44.34 
 
 
317 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  44.34 
 
 
317 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  46.97 
 
 
316 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  47.83 
 
 
359 aa  277  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  44.34 
 
 
317 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  44.55 
 
 
318 aa  276  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  44.24 
 
 
320 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  45.48 
 
 
328 aa  276  4e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  46.6 
 
 
321 aa  276  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  44.04 
 
 
323 aa  275  6e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  49.08 
 
 
333 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  44.65 
 
 
317 aa  275  6e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  49.08 
 
 
333 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  49.08 
 
 
333 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1713  thioredoxin reductase  44.17 
 
 
317 aa  275  8e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000742143  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  46.83 
 
 
316 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  44.68 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  47.53 
 
 
314 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  45.68 
 
 
321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  45.73 
 
 
316 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  48.15 
 
 
331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  44.07 
 
 
316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1932  thioredoxin reductase  43.25 
 
 
317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  46.46 
 
 
311 aa  273  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  47.26 
 
 
311 aa  273  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  46.3 
 
 
321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  44.75 
 
 
311 aa  272  5.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  44.71 
 
 
319 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  47.38 
 
 
361 aa  272  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  45.09 
 
 
316 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  43.64 
 
 
316 aa  272  6e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  45.09 
 
 
316 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2218  thioredoxin reductase  43.43 
 
 
317 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123307  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  45.23 
 
 
313 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2152  thioredoxin reductase  43.43 
 
 
317 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2188  thioredoxin reductase  43.43 
 
 
317 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000784195  normal  0.0220787 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  45.18 
 
 
320 aa  270  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  45.09 
 
 
317 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  45.18 
 
 
320 aa  270  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  45.12 
 
 
316 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  45.9 
 
 
319 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  45.71 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2289  thioredoxin reductase  44.55 
 
 
320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  45.23 
 
 
311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  45.97 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  46.65 
 
 
317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  43.77 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2014  thioredoxin reductase  43.73 
 
 
317 aa  270  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000856982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>