232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2747 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 75 aa  154  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  98.67 
 
 		 75 aa  153  8e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  54.93 
 
 		 81 aa  94.7  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  56.76 
 
 		 81 aa  92.8  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  47.95 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  52.11 
 
 		 80 aa  84  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  47.95 
 
 		 76 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  45.83 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  45.21 
 
 		 80 aa  80.9  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  45.21 
 
 		 80 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  43.84 
 
 		 80 aa  77.8  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  42.47 
 
 		 194 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  44.29 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  42.47 
 
 		 77 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  44.29 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  39.19 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  46.58 
 
 		 76 aa  70.1  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  41.1 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  39.73 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  42.19 
 
 		 383 aa  64.3  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  41.33 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  38.57 
 
 		 384 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  41.54 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  36.49 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  35.62 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  39.71 
 
 		 391 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  43.24 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  43.24 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  43.08 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  31.51 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  40.62 
 
 		 402 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  43.08 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  43.08 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 83 aa  57  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  34.25 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1784  glutaredoxin and related proteins  39.66 
 
 		 59 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  42.19 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3897  glutaredoxin family protein  34.25 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  40.62 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  34.38 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  34.72 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  37.5 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4201  glutaredoxin family protein  34.25 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  32.88 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3745  glutaredoxin family protein  34.25 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  32.88 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  35.94 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  32.88 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4003  glutaredoxin family protein  32.88 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4108  glutaredoxin family protein  32.88 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  40.62 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0113  glutaredoxin  39.34 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  32.81 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  40.62 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  36.62 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  32.81 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  40 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  34.94 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  34.94 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  32.86 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  38.89 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  31.25 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  29.85 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  32.86 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  32.86 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  39.06 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  30.56 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  32.81 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  34.85 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  36.49 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  31.94 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  39.06 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  39.06 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  36.99 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  40.3 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  41.18 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  41.18 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  37.14 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  40 
 
 		 398 aa  50.8  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>