More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0808 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  100 
 
 		 87 aa  183  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  77.01 
 
 		 87 aa  152  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  77.01 
 
 		 87 aa  152  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  51.81 
 
 		 85 aa  93.6  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  48.28 
 
 		 92 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  51.72 
 
 		 86 aa  90.9  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  45.98 
 
 		 86 aa  90.1  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  50 
 
 		 84 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  47.62 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  50 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  45.12 
 
 		 85 aa  88.2  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  50 
 
 		 84 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  50 
 
 		 85 aa  88.2  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  48.19 
 
 		 89 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  48.24 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  48.24 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  45.12 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  44.05 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  46.43 
 
 		 85 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  46.43 
 
 		 85 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  45.12 
 
 		 85 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  45.12 
 
 		 85 aa  83.6  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  49.4 
 
 		 85 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  49.41 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  46.43 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  44.58 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  44.58 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  45.12 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  44.58 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  44.58 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  44.58 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  44.58 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  44.83 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  45.78 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  43.37 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  46.43 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  42.86 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  43.37 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  52.56 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  43.37 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  50 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  48.05 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  48.05 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  47.56 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  45.45 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  42.86 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  43.53 
 
 		 88 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  43.82 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  46.99 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  48.81 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  45.88 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  43.18 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  46.99 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  44.3 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  42.35 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  43.21 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  51.76 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  44.83 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  45.68 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  44.05 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  44.32 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  48.31 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  46.99 
 
 		 85 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  46.99 
 
 		 85 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  48.05 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  48.05 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  50.65 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  44.32 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  48.05 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  48.05 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  48.19 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  42.35 
 
 		 85 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  45.24 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  46.43 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  53.25 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  45.24 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  44.44 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  44.44 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  53.25 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  46.91 
 
 		 80 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  45.78 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  46.84 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  41.86 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  46.43 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  45.78 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  48 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  45.57 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  44.58 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  45.57 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  46.91 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  41.86 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  46.75 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4389  glutaredoxin  43.53 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  46.67 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  45.78 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2122  glutaredoxin GrxC  43.02 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  44.94 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  41.67 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  48.19 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>