More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0311 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  100 
 
 
89 aa  183  7e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  49.43 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  51.85 
 
 
442 aa  93.6  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  50.63 
 
 
84 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  47.67 
 
 
90 aa  92.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  50.62 
 
 
459 aa  92.8  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  53.01 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  53.75 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  51.22 
 
 
84 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  49.38 
 
 
86 aa  90.5  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  51.22 
 
 
84 aa  90.1  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  53.09 
 
 
85 aa  90.1  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  50 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  53.09 
 
 
85 aa  90.1  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  50.65 
 
 
81 aa  89  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  53.25 
 
 
81 aa  88.6  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  50.57 
 
 
87 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  52.5 
 
 
85 aa  87.8  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  50.62 
 
 
84 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  50 
 
 
85 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  50 
 
 
85 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  52.5 
 
 
88 aa  87  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  52.5 
 
 
88 aa  87  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  51.85 
 
 
85 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  50 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  50 
 
 
85 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  48.15 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  48.81 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  48.81 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  49.38 
 
 
87 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  51.85 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  49.38 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  52.5 
 
 
88 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  50.6 
 
 
88 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  46.34 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  51.25 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  45 
 
 
86 aa  84  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  49.38 
 
 
85 aa  83.6  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  45.12 
 
 
85 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2122  glutaredoxin GrxC  48.15 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  48.75 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  45.12 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  45.88 
 
 
94 aa  82  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  45.12 
 
 
85 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  45.88 
 
 
94 aa  82  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  45.12 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  47.5 
 
 
93 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  44.83 
 
 
87 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  45 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  46.99 
 
 
87 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  45 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  47.56 
 
 
85 aa  82  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  46.91 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  42.68 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  43.9 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4197  glutaredoxin 3  47.62 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4157  glutaredoxin 3  47.62 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  44.19 
 
 
86 aa  80.1  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  47.5 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  48.15 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  48.15 
 
 
84 aa  80.1  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  46.91 
 
 
84 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  43.9 
 
 
85 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  47.5 
 
 
84 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4389  glutaredoxin  46.91 
 
 
86 aa  79.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  50 
 
 
87 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  49.4 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  44.83 
 
 
90 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  46.25 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1464  glutaredoxin 3  47.67 
 
 
86 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  46.91 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  45.88 
 
 
91 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0602  glutaredoxin 3  46.43 
 
 
91 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  44.83 
 
 
87 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  50 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  48.15 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  45.24 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  44.83 
 
 
87 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  48.19 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  46.91 
 
 
82 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  46.91 
 
 
82 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  50 
 
 
83 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  44.19 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  45.78 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  46.91 
 
 
82 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  46.25 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  47.5 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  46.25 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  45.88 
 
 
86 aa  77.4  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  43.75 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  42.5 
 
 
84 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  42.5 
 
 
84 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  47.56 
 
 
86 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  47.56 
 
 
86 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  41.98 
 
 
83 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  47.56 
 
 
86 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  47.56 
 
 
86 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  49.38 
 
 
85 aa  77  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  47.56 
 
 
86 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  47.56 
 
 
86 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>