296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2133 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  100 
 
 
87 aa  178  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  67.47 
 
 
89 aa  117  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  67.06 
 
 
87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  64.63 
 
 
82 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  62.35 
 
 
85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  66.67 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  62.07 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  62.07 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  61.9 
 
 
84 aa  110  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  62.65 
 
 
86 aa  110  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  61.18 
 
 
85 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  61.18 
 
 
85 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  63.1 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  63.53 
 
 
86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  62.35 
 
 
86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  62.35 
 
 
86 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  61.45 
 
 
84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  62.35 
 
 
86 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2174  glutaredoxin family protein  65.12 
 
 
90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  62.35 
 
 
86 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  64.29 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  58.33 
 
 
86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  64.29 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  61.9 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  64.56 
 
 
81 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  61.18 
 
 
86 aa  105  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  61.25 
 
 
81 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  58.82 
 
 
86 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  60 
 
 
85 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  60.71 
 
 
85 aa  102  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  58.82 
 
 
86 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  58.82 
 
 
86 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  58.82 
 
 
86 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  58.82 
 
 
86 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  58.82 
 
 
86 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  58.82 
 
 
86 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  59.49 
 
 
80 aa  100  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  58.33 
 
 
85 aa  100  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  60 
 
 
83 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  58.75 
 
 
83 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  59.26 
 
 
91 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  51.19 
 
 
102 aa  99.4  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  55.17 
 
 
87 aa  97.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  54.88 
 
 
96 aa  97.1  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  59.46 
 
 
89 aa  97.1  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  58.54 
 
 
94 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  58.54 
 
 
94 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  55.42 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  56.63 
 
 
84 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  56.47 
 
 
86 aa  93.6  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
84 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  54.22 
 
 
85 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  47.56 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  47.56 
 
 
101 aa  87.8  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  52.87 
 
 
86 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  54.12 
 
 
85 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  51.14 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  50 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  50 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  52.38 
 
 
84 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  52.38 
 
 
84 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  52.38 
 
 
83 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  51.19 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  49.41 
 
 
87 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  50.59 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  48.75 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  51.81 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  51.19 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  51.19 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  51.81 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  48.19 
 
 
82 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  48.19 
 
 
82 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  48.19 
 
 
82 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  49.41 
 
 
85 aa  80.1  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  49.41 
 
 
84 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  48.28 
 
 
92 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  51.19 
 
 
83 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  48.84 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  51.25 
 
 
115 aa  80.1  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  49.41 
 
 
84 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  51.19 
 
 
83 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  51.69 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  46.51 
 
 
87 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  46.51 
 
 
87 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  47.06 
 
 
85 aa  77  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  47.06 
 
 
85 aa  77  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  47.06 
 
 
86 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  48.19 
 
 
82 aa  77  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  46.99 
 
 
83 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  50 
 
 
86 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  46.99 
 
 
83 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  46.99 
 
 
83 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  46.99 
 
 
83 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  48.84 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  50 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  46.99 
 
 
83 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  42.86 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  52.56 
 
 
84 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  49.41 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  49.41 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>