More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4101 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  100 
 
 		 86 aa  177  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  85.54 
 
 		 85 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  85.54 
 
 		 85 aa  149  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  84.52 
 
 		 85 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  84.34 
 
 		 85 aa  148  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  79.07 
 
 		 86 aa  144  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  75.58 
 
 		 89 aa  140  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  74.07 
 
 		 91 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  70.93 
 
 		 86 aa  131  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  68.6 
 
 		 87 aa  130  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  73.75 
 
 		 80 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  69.51 
 
 		 86 aa  123  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  63.95 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  63.95 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  63.95 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  62.79 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  65.43 
 
 		 81 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  61.63 
 
 		 86 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  65 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  60.47 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  60.47 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  60.47 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  60.47 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  65.06 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  60.47 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  61.18 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  60.47 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  61.18 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  64.2 
 
 		 81 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  63.53 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  63.86 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  61.73 
 
 		 83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  59.76 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  60.49 
 
 		 83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  62.5 
 
 		 82 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  63.86 
 
 		 84 aa  107  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  60.24 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  60.24 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  61.45 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  61.9 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  59.04 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  57.83 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  57.83 
 
 		 82 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  57.83 
 
 		 82 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  57.83 
 
 		 82 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  57.83 
 
 		 82 aa  97.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 86 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  56.63 
 
 		 85 aa  97.1  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 83 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 83 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 83 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 83 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 83 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 83 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 83 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 83 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 83 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 83 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 83 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 83 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2174  glutaredoxin family protein  55.81 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 83 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  55.95 
 
 		 83 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  56.25 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  54.22 
 
 		 83 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  57.14 
 
 		 87 aa  93.6  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  56.79 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  51.76 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  51.81 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  54.22 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4078  glutaredoxin 3  54.32 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378056 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  56.25 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  57.65 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  51.81 
 
 		 84 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  50.59 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  53.09 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  54.76 
 
 		 85 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  53.57 
 
 		 84 aa  90.9  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 84 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  54.76 
 
 		 85 aa  90.5  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  52.94 
 
 		 84 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  52.94 
 
 		 84 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  50.6 
 
 		 87 aa  89.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  53.57 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  54.65 
 
 		 85 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  53.49 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 84 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  53.66 
 
 		 94 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  53.66 
 
 		 94 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  54.32 
 
 		 86 aa  87.8  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  53.09 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>