More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4883 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  100 
 
 
83 aa  173  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  97.59 
 
 
83 aa  169  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  87.95 
 
 
84 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  87.95 
 
 
84 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  86.75 
 
 
84 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  89.02 
 
 
84 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  82.93 
 
 
86 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  84.15 
 
 
84 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  76.83 
 
 
84 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  72.29 
 
 
83 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  72.29 
 
 
84 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  71.08 
 
 
84 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  63.86 
 
 
84 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  56.63 
 
 
87 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  61.45 
 
 
84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  59.76 
 
 
84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  58.54 
 
 
84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  60 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  58.54 
 
 
88 aa  107  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  58.54 
 
 
88 aa  107  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  61.9 
 
 
85 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  57.32 
 
 
88 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  57.14 
 
 
85 aa  103  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  54.88 
 
 
83 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  54.88 
 
 
83 aa  102  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  54.88 
 
 
83 aa  102  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  54.88 
 
 
83 aa  102  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  54.88 
 
 
83 aa  102  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  54.88 
 
 
83 aa  102  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  54.88 
 
 
83 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  54.88 
 
 
83 aa  102  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  54.88 
 
 
83 aa  102  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  59.52 
 
 
85 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  59.52 
 
 
85 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  59.52 
 
 
85 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  59.04 
 
 
89 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  53.01 
 
 
84 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  61.9 
 
 
85 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  56.1 
 
 
84 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  58.54 
 
 
86 aa  100  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  53.57 
 
 
85 aa  101  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  54.76 
 
 
85 aa  100  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  53.66 
 
 
83 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  53.66 
 
 
83 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  53.66 
 
 
83 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  57.14 
 
 
85 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  53.66 
 
 
83 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  53.66 
 
 
83 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  57.14 
 
 
88 aa  98.6  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  55.95 
 
 
85 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  55.95 
 
 
85 aa  97.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  58.33 
 
 
85 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  52.44 
 
 
82 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  52.44 
 
 
82 aa  97.1  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  52.44 
 
 
82 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  56.63 
 
 
84 aa  97.1  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  55.95 
 
 
84 aa  97.1  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  51.81 
 
 
84 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  57.14 
 
 
85 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  54.76 
 
 
88 aa  96.7  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  53.57 
 
 
85 aa  96.7  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  57.14 
 
 
85 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  51.81 
 
 
84 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  51.22 
 
 
82 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  58.97 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  55.42 
 
 
86 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  55.95 
 
 
84 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  51.22 
 
 
82 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  53.57 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  54.88 
 
 
86 aa  95.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  53.57 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  55.95 
 
 
87 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  51.81 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1464  glutaredoxin 3  54.43 
 
 
86 aa  94.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2122  glutaredoxin GrxC  56.63 
 
 
85 aa  94.4  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  53.09 
 
 
102 aa  94.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  54.22 
 
 
89 aa  94  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  56.63 
 
 
85 aa  94  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
86 aa  94  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  50.6 
 
 
84 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  54.76 
 
 
87 aa  93.6  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  50 
 
 
84 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  55.29 
 
 
89 aa  92.8  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  49.4 
 
 
86 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  49.4 
 
 
86 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  52.44 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  54.76 
 
 
85 aa  92  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  49.4 
 
 
86 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  49.4 
 
 
86 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  48.19 
 
 
85 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  53.01 
 
 
93 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  49.4 
 
 
86 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  49.4 
 
 
86 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  51.81 
 
 
110 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4389  glutaredoxin  48.19 
 
 
86 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  55.42 
 
 
86 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  52.38 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  54.76 
 
 
85 aa  90.9  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  48.78 
 
 
84 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>