292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02490 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  100 
 
 
102 aa  213  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  76.29 
 
 
96 aa  157  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  70.41 
 
 
101 aa  153  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  69.39 
 
 
101 aa  150  5e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  51.19 
 
 
87 aa  99.4  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  53.09 
 
 
84 aa  98.6  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  48.81 
 
 
88 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  52.44 
 
 
86 aa  98.2  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  53.01 
 
 
84 aa  97.4  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  47.67 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  50.6 
 
 
86 aa  95.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  47.62 
 
 
87 aa  94.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  53.09 
 
 
83 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  53.01 
 
 
86 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  53.09 
 
 
83 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  51.22 
 
 
85 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  51.81 
 
 
86 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  53.75 
 
 
85 aa  92  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  52.44 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  51.85 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  48.78 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  48.75 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  51.28 
 
 
80 aa  91.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  49.4 
 
 
87 aa  90.9  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  49.38 
 
 
86 aa  90.9  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  48.24 
 
 
87 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  48.24 
 
 
87 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  53.75 
 
 
84 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  48.75 
 
 
85 aa  90.5  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  48.75 
 
 
85 aa  90.1  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  52.5 
 
 
84 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  48.75 
 
 
85 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  52.5 
 
 
84 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  45.24 
 
 
91 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  46.43 
 
 
87 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  43.21 
 
 
85 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  53.09 
 
 
85 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  49.38 
 
 
84 aa  88.6  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  51.9 
 
 
84 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  53.09 
 
 
85 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  51.9 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  53.09 
 
 
85 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  49.38 
 
 
85 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  46.84 
 
 
84 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  44.58 
 
 
85 aa  87  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  51.19 
 
 
89 aa  87  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  45.12 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  48.78 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  50 
 
 
81 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  46.34 
 
 
85 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  45.24 
 
 
86 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  45.24 
 
 
86 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  46.34 
 
 
86 aa  85.5  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  48.15 
 
 
86 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  45.24 
 
 
86 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  45.24 
 
 
86 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  45.24 
 
 
86 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  45.57 
 
 
84 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  46.25 
 
 
82 aa  84  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  46.25 
 
 
82 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  46.25 
 
 
82 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  45.12 
 
 
84 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  46.67 
 
 
92 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  48.72 
 
 
81 aa  83.6  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  42.17 
 
 
85 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  46.25 
 
 
83 aa  82.8  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  42.17 
 
 
85 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  48.15 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  43.9 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  46.91 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  44.94 
 
 
94 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  44.94 
 
 
94 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  47.5 
 
 
82 aa  81.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  41.25 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  42.86 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  42.86 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  42.86 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  42.86 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  42.86 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  41.25 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  48.78 
 
 
86 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  42.86 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  47.56 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  44.44 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  45 
 
 
93 aa  80.1  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2122  glutaredoxin GrxC  44.44 
 
 
85 aa  80.1  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  46.91 
 
 
86 aa  80.1  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  43.37 
 
 
83 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  43.37 
 
 
83 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  45.45 
 
 
95 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  47.56 
 
 
85 aa  80.1  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  44.58 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1464  glutaredoxin 3  45 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  45.78 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  41.46 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  42.68 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  41.98 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  41.98 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  43.75 
 
 
83 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  46.91 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>