More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2772 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  100 
 
 		 86 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  96.51 
 
 		 86 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  96.51 
 
 		 86 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  97.67 
 
 		 86 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  96.51 
 
 		 86 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  97.53 
 
 		 81 aa  163  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  95.06 
 
 		 81 aa  160  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  87.21 
 
 		 86 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  87.21 
 
 		 86 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  87.21 
 
 		 86 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  87.21 
 
 		 86 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  87.21 
 
 		 86 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  87.21 
 
 		 86 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  82.35 
 
 		 87 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  82.35 
 
 		 87 aa  152  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  86.75 
 
 		 83 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  85.54 
 
 		 83 aa  150  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  80 
 
 		 85 aa  148  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  85 
 
 		 82 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  76.47 
 
 		 85 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  76.47 
 
 		 85 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  77.65 
 
 		 85 aa  140  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  75.29 
 
 		 85 aa  138  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  75.9 
 
 		 84 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  73.49 
 
 		 84 aa  130  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  73.17 
 
 		 89 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  68.24 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  68.24 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  68.67 
 
 		 91 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  67.44 
 
 		 86 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  66.67 
 
 		 87 aa  120  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  65.88 
 
 		 85 aa  120  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  64.71 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  62.79 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  66.27 
 
 		 86 aa  114  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  67.5 
 
 		 80 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  61.63 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  62.35 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  58.14 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  60.24 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  54.65 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  60 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  57.5 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2174  glutaredoxin family protein  58.14 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 84 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  51.81 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  51.81 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  51.81 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  50.62 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  49.41 
 
 		 84 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  49.4 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  49.38 
 
 		 101 aa  92  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  48.84 
 
 		 86 aa  90.1  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  48.24 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  50.6 
 
 		 82 aa  87.8  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  50 
 
 		 83 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  50 
 
 		 83 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  50 
 
 		 83 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  50 
 
 		 83 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  50 
 
 		 83 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  50 
 
 		 83 aa  87.8  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  50 
 
 		 83 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  50 
 
 		 83 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  50.59 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  47.62 
 
 		 83 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  49.4 
 
 		 83 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  47.62 
 
 		 83 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  47.62 
 
 		 83 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  47.62 
 
 		 83 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  47.62 
 
 		 83 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  49.41 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  49.4 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  49.41 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  50 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  48.24 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  45.24 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  48.24 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  48.24 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  53.66 
 
 		 94 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  53.66 
 
 		 94 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  51.16 
 
 		 85 aa  84  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  45.78 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  51.81 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  46.99 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  53.09 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  45.78 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  48.81 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  49.41 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  47.67 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  48.28 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2024  glutaredoxin  48.15 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  45.88 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  47.06 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  45.88 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  50.6 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  49.41 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>