More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0033 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  100 
 
 		 85 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  57.14 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  60.98 
 
 		 84 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  60.98 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  56.63 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  56.63 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  56.1 
 
 		 84 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  56.1 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  55.42 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  53.66 
 
 		 84 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  53.66 
 
 		 84 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 84 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  51.81 
 
 		 84 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 85 aa  90.1  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  51.16 
 
 		 86 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  54.22 
 
 		 87 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  51.16 
 
 		 86 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  51.16 
 
 		 86 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  51.19 
 
 		 85 aa  89.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  51.16 
 
 		 86 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  51.16 
 
 		 86 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  51.16 
 
 		 86 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  43.21 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  49.4 
 
 		 83 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2122  glutaredoxin GrxC  56.63 
 
 		 85 aa  88.2  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  49.4 
 
 		 83 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  50 
 
 		 84 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  44.44 
 
 		 96 aa  87.8  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  49.4 
 
 		 83 aa  87  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  48.78 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  47.62 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  49.4 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  47.56 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  46.51 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  43.21 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  48.19 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  49.4 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  50 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  52.94 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  49.4 
 
 		 83 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  43.21 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  48.81 
 
 		 84 aa  84  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  46.34 
 
 		 84 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  48.19 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  48.19 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  47.62 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  48.19 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  47.62 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  48.19 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  48.19 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  52.5 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  51.81 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  48.19 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4389  glutaredoxin  50.6 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  53.66 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  49.4 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  47.67 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  44.58 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  49.4 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  47.5 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  40 
 
 		 85 aa  80.1  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  46.51 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  46.51 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  46.51 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  53.75 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  48.65 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  43.37 
 
 		 85 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  53.75 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  48.19 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  44.05 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  46.43 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  48.19 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  46.51 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  47.56 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  47.56 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  48.19 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  47.56 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  51.35 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  46.99 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  50 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  50 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  45.35 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  44.71 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  44.71 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  48.19 
 
 		 85 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  45.78 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1464  glutaredoxin 3  50 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  48.19 
 
 		 85 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  48.15 
 
 		 85 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  45.24 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  43.9 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  50 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  42.86 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  46.51 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>