More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0496 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  100 
 
 		 84 aa  176  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  65.06 
 
 		 84 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  65.06 
 
 		 84 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  63.86 
 
 		 83 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  63.86 
 
 		 83 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  64.63 
 
 		 84 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  65.85 
 
 		 86 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  62.65 
 
 		 84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  62.65 
 
 		 84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  61.45 
 
 		 84 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  63.41 
 
 		 84 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  63.86 
 
 		 83 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  62.2 
 
 		 84 aa  114  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  49.4 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  56.47 
 
 		 85 aa  97.4  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  54.32 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  50.6 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  52.38 
 
 		 85 aa  94.4  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  53.57 
 
 		 85 aa  94.4  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  52.44 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 83 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 83 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  52.94 
 
 		 87 aa  93.6  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 83 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 83 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 83 aa  93.6  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  51.22 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  51.22 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  54.32 
 
 		 86 aa  93.2  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  52.38 
 
 		 85 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2122  glutaredoxin GrxC  57.83 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  52.38 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  53.01 
 
 		 84 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  52.38 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 85 aa  91.7  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  55.95 
 
 		 85 aa  90.9  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.838286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 83 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 83 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  53.57 
 
 		 85 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 83 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 83 aa  90.5  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  53.57 
 
 		 85 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 83 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  48.78 
 
 		 83 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 83 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 83 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 83 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  52.38 
 
 		 86 aa  89.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  47.56 
 
 		 82 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  53.57 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  51.22 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  50 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  50 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  45.78 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  52.38 
 
 		 85 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 85 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  53.01 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  50 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  51.19 
 
 		 88 aa  87  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  47.62 
 
 		 88 aa  86.7  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  51.25 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  50.6 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  48.81 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  45.12 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  50 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  45.12 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  45.12 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4197  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4157  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  48.05 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  48.81 
 
 		 84 aa  84.7  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  49.41 
 
 		 88 aa  84.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4389  glutaredoxin  49.4 
 
 		 86 aa  84.3  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  44.58 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  51.25 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2144  glutaredoxin 3  50 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2100  glutaredoxin 3  50 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2777  glutaredoxin 3  49.38 
 
 		 102 aa  84.3  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  48.81 
 
 		 85 aa  84  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  50.6 
 
 		 87 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  50.6 
 
 		 85 aa  83.6  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  48.81 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  48.81 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  48.19 
 
 		 83 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  45.68 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  45.78 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  45.78 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  46.91 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  45.78 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  46.91 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1464  glutaredoxin 3  52.5 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  45.78 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  48.19 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>