More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2903 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  100 
 
 		 85 aa  177  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  72.62 
 
 		 85 aa  136  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  62.35 
 
 		 86 aa  122  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  63.1 
 
 		 85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  63.1 
 
 		 85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  64.29 
 
 		 85 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  61.18 
 
 		 85 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  57.65 
 
 		 85 aa  113  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  60 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  60 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  60 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  58.82 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  59.52 
 
 		 85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0602  glutaredoxin 3  59.26 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  57.65 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  57.83 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  56.63 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  57.65 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0519  glutaredoxin GrxC  55.56 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0106  glutaredoxin GrxC  58.02 
 
 		 96 aa  103  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  56.47 
 
 		 88 aa  103  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0025  glutaredoxin GrxC  56.79 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  57.65 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  50.6 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  56.47 
 
 		 84 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  55.29 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  56.79 
 
 		 86 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  55.29 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  55.42 
 
 		 88 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  52.94 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  52.94 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  54.12 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  50 
 
 		 85 aa  97.8  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 85 aa  97.4  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  54.22 
 
 		 86 aa  97.1  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  53.57 
 
 		 88 aa  97.1  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  53.01 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  56.63 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2122  glutaredoxin GrxC  54.22 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  54.22 
 
 		 84 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  53.57 
 
 		 84 aa  94.4  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1464  glutaredoxin 3  51.81 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  53.66 
 
 		 86 aa  94  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  53.09 
 
 		 85 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 84 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  53.01 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  55.42 
 
 		 84 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  50.59 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  51.76 
 
 		 84 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  51.81 
 
 		 86 aa  92  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4389  glutaredoxin  48.19 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  51.81 
 
 		 86 aa  92  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  52.38 
 
 		 83 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  54.22 
 
 		 83 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  53.01 
 
 		 87 aa  90.9  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  90.9  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  51.76 
 
 		 86 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  47.5 
 
 		 81 aa  90.9  6e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2777  glutaredoxin 3  51.25 
 
 		 102 aa  90.1  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  50 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  50 
 
 		 81 aa  89.7  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 83 aa  89.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  51.19 
 
 		 83 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2144  glutaredoxin 3  50 
 
 		 104 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  50 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  48.24 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2100  glutaredoxin 3  50 
 
 		 104 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  50 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  53.75 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  50.6 
 
 		 84 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  45.12 
 
 		 87 aa  88.2  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  48.19 
 
 		 84 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  48.19 
 
 		 87 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  48.19 
 
 		 84 aa  87.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  50 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  51.25 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  48.19 
 
 		 87 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  51.76 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>