More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0106 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0106  glutaredoxin GrxC  100 
 
 		 96 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0602  glutaredoxin 3  92.22 
 
 		 91 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0025  glutaredoxin GrxC  85.39 
 
 		 91 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0519  glutaredoxin GrxC  81.11 
 
 		 113 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  72.22 
 
 		 90 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  60.98 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  60.98 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  65.38 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  65.38 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  58.02 
 
 		 85 aa  103  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  59.76 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  60.98 
 
 		 93 aa  103  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  60.98 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  62.2 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  57.83 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  59.76 
 
 		 85 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  60 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  58.33 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  62.5 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  57.14 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  49.4 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  54.32 
 
 		 85 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 88 aa  93.6  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  53.49 
 
 		 88 aa  93.6  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1464  glutaredoxin 3  53.57 
 
 		 86 aa  93.2  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  53.09 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 84 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 85 aa  92  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  50.59 
 
 		 86 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  55.42 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 85 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 85 aa  90.9  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 85 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  52.44 
 
 		 87 aa  88.2  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  50.59 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  51.81 
 
 		 87 aa  87  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  48.24 
 
 		 86 aa  87  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4078  glutaredoxin 3  48.81 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378056 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  53.75 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2777  glutaredoxin 3  49.41 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  51.81 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  50 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  51.22 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  53.75 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  48.78 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  48.78 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  47.56 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  50 
 
 		 84 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  51.22 
 
 		 84 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  53.09 
 
 		 84 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  53.09 
 
 		 84 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  53.09 
 
 		 84 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4207  glutaredoxin 3  48.81 
 
 		 86 aa  84  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.720183 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  51.22 
 
 		 84 aa  83.6  7e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  51.22 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4389  glutaredoxin  46.34 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  50.6 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2144  glutaredoxin 3  48.24 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2100  glutaredoxin 3  48.24 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  52.5 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  52.44 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  52.44 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  52.44 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  52.5 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  51.81 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  50.62 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4197  glutaredoxin 3  49.41 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  50 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4157  glutaredoxin 3  49.41 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  52.38 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 83 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  48.81 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  52.44 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  48.78 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  47.56 
 
 		 85 aa  78.2  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  46.99 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  44.71 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  47.06 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  44.05 
 
 		 89 aa  76.6  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  47.56 
 
 		 82 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  46.34 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>