More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1876 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  100 
 
 		 90 aa  183  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  56.98 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  54.88 
 
 		 85 aa  94  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 85 aa  94  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  47.67 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  54.88 
 
 		 86 aa  92.8  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  53.09 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  56.1 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  52.44 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  52.44 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  52.44 
 
 		 85 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  49.4 
 
 		 96 aa  90.1  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  49.4 
 
 		 96 aa  90.1  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  55.56 
 
 		 86 aa  90.1  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  51.85 
 
 		 85 aa  90.1  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  51.76 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  50 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  48.05 
 
 		 81 aa  88.6  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  52.44 
 
 		 85 aa  88.6  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2100  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2144  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  50 
 
 		 85 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  50.6 
 
 		 84 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  50.6 
 
 		 84 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  54.22 
 
 		 87 aa  87.8  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  50.6 
 
 		 84 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  55 
 
 		 88 aa  87  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  55 
 
 		 88 aa  87  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  49.38 
 
 		 81 aa  87  8e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  48.24 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  51.85 
 
 		 83 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  51.25 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  50.62 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  52.5 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1464  glutaredoxin 3  50 
 
 		 86 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  51.25 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  53.75 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  50 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  50 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  58.75 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0602  glutaredoxin 3  47.78 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  53.75 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  58.75 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0106  glutaredoxin GrxC  50 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  58.75 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  51.85 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  55.56 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  50 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  52.5 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  51.25 
 
 		 84 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  51.25 
 
 		 84 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0519  glutaredoxin GrxC  47.06 
 
 		 113 aa  83.6  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  50.62 
 
 		 83 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  51.25 
 
 		 88 aa  83.6  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  48.78 
 
 		 85 aa  83.6  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2777  glutaredoxin 3  48.15 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  53.75 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  51.85 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  45.35 
 
 		 86 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  46.91 
 
 		 86 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  50 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  51.85 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  48.15 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  52.94 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  48.75 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  52.5 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  52.5 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  50 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  47.06 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  51.25 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  54.32 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  54.32 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  54.32 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  54.32 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  50 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4389  glutaredoxin  45.68 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0025  glutaredoxin GrxC  50 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4078  glutaredoxin 3  45.24 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  45.24 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  54.32 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  52.5 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  50 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  50 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  45.68 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  48.78 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  47.56 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  48.78 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  53.09 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  48.75 
 
 		 87 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  43.18 
 
 		 87 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>