More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_4139 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  100 
 
 
82 aa  171  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  100 
 
 
82 aa  171  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  100 
 
 
82 aa  171  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  85.37 
 
 
83 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  85.37 
 
 
83 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  85.37 
 
 
83 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  85.37 
 
 
83 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  86.59 
 
 
82 aa  149  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  84.15 
 
 
83 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  82.93 
 
 
82 aa  146  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  78.05 
 
 
83 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  78.05 
 
 
83 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  78.05 
 
 
83 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  78.05 
 
 
83 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  78.05 
 
 
83 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  78.05 
 
 
83 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  78.05 
 
 
83 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  78.05 
 
 
83 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  78.05 
 
 
83 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  67.47 
 
 
87 aa  115  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  63.41 
 
 
85 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  60.24 
 
 
86 aa  107  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  59.76 
 
 
84 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  62.65 
 
 
88 aa  104  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  60.98 
 
 
103 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  59.04 
 
 
88 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2122  glutaredoxin GrxC  60.24 
 
 
85 aa  103  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  56.1 
 
 
84 aa  103  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  59.76 
 
 
110 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  59.04 
 
 
85 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  56.1 
 
 
84 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  56.1 
 
 
84 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  59.04 
 
 
85 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  55.42 
 
 
85 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  56.1 
 
 
83 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4078  glutaredoxin 3  56.1 
 
 
105 aa  100  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378056 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  60.24 
 
 
88 aa  100  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  60.24 
 
 
85 aa  100  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  60.24 
 
 
85 aa  100  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2144  glutaredoxin 3  60.98 
 
 
104 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2100  glutaredoxin 3  60.98 
 
 
104 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  56.63 
 
 
85 aa  100  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  57.83 
 
 
86 aa  99.4  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4197  glutaredoxin 3  58.54 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  59.04 
 
 
86 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4157  glutaredoxin 3  58.54 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
85 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  56.1 
 
 
84 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  55.42 
 
 
85 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  56.1 
 
 
86 aa  98.6  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  56.1 
 
 
86 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  57.32 
 
 
91 aa  99.4  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  52.44 
 
 
87 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  57.83 
 
 
86 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  52.44 
 
 
84 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  53.01 
 
 
85 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  57.83 
 
 
85 aa  98.2  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  57.83 
 
 
85 aa  98.2  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  55.42 
 
 
85 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  56.63 
 
 
89 aa  98.2  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  55.42 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  56.63 
 
 
85 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  52.44 
 
 
84 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  52.44 
 
 
86 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  52.44 
 
 
84 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  57.32 
 
 
86 aa  97.4  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  54.22 
 
 
85 aa  97.1  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  52.44 
 
 
83 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  51.22 
 
 
84 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  57.32 
 
 
84 aa  97.1  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  53.01 
 
 
87 aa  97.1  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  51.81 
 
 
85 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  61.45 
 
 
86 aa  96.7  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  54.22 
 
 
87 aa  96.7  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
87 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  51.81 
 
 
85 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  53.01 
 
 
85 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  55.42 
 
 
88 aa  96.7  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  58.54 
 
 
87 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  53.01 
 
 
85 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4207  glutaredoxin 3  54.88 
 
 
86 aa  96.3  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.720183 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  56.1 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  52.44 
 
 
83 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  56.1 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
85 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2777  glutaredoxin 3  56.1 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  51.81 
 
 
86 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  51.81 
 
 
86 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  56.96 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  51.81 
 
 
86 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  54.88 
 
 
84 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  51.81 
 
 
86 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  55.42 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  55.42 
 
 
86 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  56.1 
 
 
84 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  56.63 
 
 
85 aa  94.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  50.6 
 
 
85 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  56.63 
 
 
84 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>