More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0230 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  100 
 
 		 85 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  100 
 
 		 85 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  92.94 
 
 		 85 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  89.41 
 
 		 85 aa  157  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  82.35 
 
 		 85 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  76.47 
 
 		 86 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  76.47 
 
 		 86 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  77.65 
 
 		 86 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  77.65 
 
 		 86 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  77.65 
 
 		 86 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  78.75 
 
 		 81 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  80 
 
 		 81 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  71.76 
 
 		 87 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  71.76 
 
 		 87 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  75 
 
 		 82 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  74.12 
 
 		 86 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  74.12 
 
 		 86 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  74.12 
 
 		 86 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  74.12 
 
 		 86 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  74.12 
 
 		 86 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  74.12 
 
 		 86 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  74.39 
 
 		 83 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  73.17 
 
 		 83 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  69.05 
 
 		 84 aa  122  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  68.67 
 
 		 84 aa  122  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  66.27 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  64.71 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  61.18 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  61.18 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  61.18 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  60 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  61.18 
 
 		 87 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  60.71 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  59.76 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  58.82 
 
 		 85 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  60.24 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  58.54 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  54.12 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  61.25 
 
 		 80 aa  100  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2174  glutaredoxin family protein  59.3 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  55.29 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  55.42 
 
 		 86 aa  99.4  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  53.66 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 82 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 82 aa  95.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 82 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 85 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  55.13 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 82 aa  92  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  91.3  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  50.62 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  54.22 
 
 		 83 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 83 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 83 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 83 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 83 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 84 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  51.76 
 
 		 87 aa  90.1  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  47.5 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  48.84 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  48.24 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  46.25 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  47.06 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  48.84 
 
 		 85 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  49.4 
 
 		 82 aa  84.3  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 83 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  48.84 
 
 		 85 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  48.84 
 
 		 85 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  48.19 
 
 		 86 aa  84  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  47.62 
 
 		 83 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  47.62 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  47.62 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  47.06 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  47.06 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  42.17 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  48.84 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  48.24 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  48.81 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  47.06 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  48.24 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  47.06 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  49.4 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  50 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  49.4 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  48.84 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  51.16 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  50 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  50 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  50 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  48.19 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  46.99 
 
 		 84 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  44.05 
 
 		 87 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>