More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1123 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  100 
 
 
89 aa  181  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  75.31 
 
 
86 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  75.31 
 
 
86 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  75.31 
 
 
86 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  75.31 
 
 
86 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  75.31 
 
 
86 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  75.31 
 
 
86 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  73.17 
 
 
86 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  71.08 
 
 
85 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  74.07 
 
 
86 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  74.07 
 
 
86 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  74.07 
 
 
86 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  71.95 
 
 
86 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  73.75 
 
 
83 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  72.5 
 
 
83 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  73.08 
 
 
81 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  69.14 
 
 
87 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  69.14 
 
 
87 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  69.88 
 
 
85 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  71.79 
 
 
81 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  71.79 
 
 
82 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  66.27 
 
 
85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  66.27 
 
 
85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  66.27 
 
 
85 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  66.67 
 
 
87 aa  115  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  65.06 
 
 
85 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  66.67 
 
 
84 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  64.2 
 
 
85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  67.9 
 
 
84 aa  114  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  64.2 
 
 
85 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  64.2 
 
 
85 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  65 
 
 
86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  66.67 
 
 
87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  60.24 
 
 
91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  65.06 
 
 
86 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  63.75 
 
 
86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  60 
 
 
85 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  64.1 
 
 
80 aa  107  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  58.75 
 
 
89 aa  105  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  58.02 
 
 
87 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  62.82 
 
 
89 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  58.75 
 
 
86 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  52.81 
 
 
88 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  55.42 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  54.22 
 
 
83 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  51.22 
 
 
84 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  54.22 
 
 
83 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  56.63 
 
 
83 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  47.06 
 
 
96 aa  92.8  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  54.88 
 
 
86 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  53.66 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  50 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  54.32 
 
 
84 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  53.75 
 
 
115 aa  89.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2174  glutaredoxin family protein  57.5 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  54.32 
 
 
84 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  53.09 
 
 
84 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  52.44 
 
 
84 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  52.5 
 
 
84 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  45.12 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  49.38 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  50.59 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
94 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
94 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  49.38 
 
 
84 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  44.05 
 
 
101 aa  84  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  50.62 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  50.62 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  52.5 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  44.05 
 
 
101 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  45.78 
 
 
87 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  47.56 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  47.56 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  47.56 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  47.62 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  44.05 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  45.78 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2024  glutaredoxin  48.05 
 
 
92 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  51.22 
 
 
85 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  44.58 
 
 
84 aa  76.6  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  46.99 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  48.78 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  45.78 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  45.78 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  48.78 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  48.78 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  45.88 
 
 
86 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  47.06 
 
 
87 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  46.34 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  50 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  43.9 
 
 
82 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  44.71 
 
 
85 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  47.62 
 
 
85 aa  73.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  47.06 
 
 
87 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  45.24 
 
 
86 aa  73.6  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  45.12 
 
 
83 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  42.68 
 
 
83 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  45.12 
 
 
83 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  46.43 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  42.68 
 
 
83 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>