More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5105 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  100 
 
 		 84 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  98.81 
 
 		 84 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  98.81 
 
 		 84 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  91.67 
 
 		 84 aa  163  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  86.75 
 
 		 83 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  88.1 
 
 		 84 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  84.34 
 
 		 83 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  79.27 
 
 		 86 aa  144  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  71.95 
 
 		 84 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  69.05 
 
 		 84 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  67.86 
 
 		 84 aa  133  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  68.67 
 
 		 83 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  61.45 
 
 		 84 aa  117  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  61.9 
 
 		 84 aa  114  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  63.53 
 
 		 85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  62.35 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  62.35 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  60.76 
 
 		 88 aa  110  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  62.35 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  59.52 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  61.45 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  65.48 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  58.54 
 
 		 88 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  58.54 
 
 		 88 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  56.1 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  54.88 
 
 		 84 aa  103  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  58.33 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  56.1 
 
 		 83 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  56.1 
 
 		 83 aa  103  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  56.1 
 
 		 83 aa  103  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  56.1 
 
 		 83 aa  103  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  56.1 
 
 		 83 aa  103  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  56.1 
 
 		 83 aa  103  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  56.1 
 
 		 83 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  56.1 
 
 		 83 aa  103  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  56.1 
 
 		 83 aa  103  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  56.1 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  57.65 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  55.29 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  59.26 
 
 		 86 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  53.66 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  53.66 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  53.66 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  53.66 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  53.66 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  56.47 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  53.57 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  58.33 
 
 		 85 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  57.65 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  54.76 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  58.33 
 
 		 85 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  57.65 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  55.56 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  51.19 
 
 		 84 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 85 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 85 aa  97.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  53.57 
 
 		 85 aa  97.8  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  52.44 
 
 		 82 aa  97.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 82 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 82 aa  97.1  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 82 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  54.32 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  55.29 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  56.63 
 
 		 87 aa  97.1  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  57.14 
 
 		 84 aa  96.7  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  51.76 
 
 		 88 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  51.22 
 
 		 82 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  50 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  56.25 
 
 		 86 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  55 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2122  glutaredoxin GrxC  54.12 
 
 		 85 aa  94.7  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  54.65 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  51.81 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  53.57 
 
 		 85 aa  94.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  52.38 
 
 		 88 aa  94.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 86 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 86 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  51.81 
 
 		 84 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 86 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 86 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 86 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 86 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  55.29 
 
 		 85 aa  93.6  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1464  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 86 aa  93.6  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  53.01 
 
 		 84 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 85 aa  93.6  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  54.32 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  53.75 
 
 		 80 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  55.29 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  51.76 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  51.81 
 
 		 84 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  51.9 
 
 		 87 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  51.9 
 
 		 87 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  53.01 
 
 		 86 aa  92  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  51.76 
 
 		 87 aa  92  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  51.81 
 
 		 86 aa  92  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4078  glutaredoxin 3  51.25 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>