More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2509 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  100 
 
 		 85 aa  177  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  74.12 
 
 		 85 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  72.94 
 
 		 85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  67.06 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  61.45 
 
 		 93 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  58.82 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  61.18 
 
 		 85 aa  108  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  61.18 
 
 		 88 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  60 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  57.65 
 
 		 85 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  60 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  60 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  57.14 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  61.45 
 
 		 88 aa  98.2  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  54.22 
 
 		 86 aa  97.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  61.45 
 
 		 88 aa  98.2  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  54.76 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  55.95 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  57.32 
 
 		 86 aa  94.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0519  glutaredoxin GrxC  51.81 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0602  glutaredoxin 3  55.42 
 
 		 91 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 83 aa  92.8  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  55.29 
 
 		 84 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  55.29 
 
 		 84 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  56.63 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  54.76 
 
 		 85 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  54.76 
 
 		 85 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 85 aa  92.8  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  55.29 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  55.95 
 
 		 85 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  53.75 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  50.59 
 
 		 86 aa  91.3  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  54.76 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 85 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0106  glutaredoxin GrxC  54.22 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  56.63 
 
 		 86 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  54.12 
 
 		 85 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  54.88 
 
 		 87 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  57.14 
 
 		 83 aa  90.5  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  59.04 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  54.76 
 
 		 83 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0025  glutaredoxin GrxC  53.01 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4197  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  52.5 
 
 		 81 aa  89.4  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  53.01 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  53.57 
 
 		 84 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4157  glutaredoxin 3  53.01 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4389  glutaredoxin  51.76 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  51.76 
 
 		 84 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  51.76 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  51.19 
 
 		 85 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 84 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2777  glutaredoxin 3  53.66 
 
 		 102 aa  87.8  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  51.81 
 
 		 84 aa  87.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  51.81 
 
 		 84 aa  87.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 85 aa  87  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2144  glutaredoxin 3  49.4 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2100  glutaredoxin 3  49.4 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 85 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 85 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  49.4 
 
 		 84 aa  86.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  53.66 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  50 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  51.81 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  50.6 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  50 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  50.6 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  50.6 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  49.4 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  49.41 
 
 		 85 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  53.01 
 
 		 87 aa  85.1  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  50 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4078  glutaredoxin 3  50 
 
 		 105 aa  84.3  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378056 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  52.94 
 
 		 86 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  56.47 
 
 		 85 aa  83.6  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  49.4 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2122  glutaredoxin GrxC  49.41 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  50.59 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  51.81 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  46.43 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  46.99 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  54.22 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  45.24 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  54.65 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  54.22 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  45.24 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  45.24 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  49.4 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  47.56 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  54.22 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>