More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0854 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 80 aa  164  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  72.5 
 
 		 80 aa  127  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  71.25 
 
 		 80 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  70 
 
 		 80 aa  124  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  63.75 
 
 		 80 aa  119  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  64.94 
 
 		 81 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  59.15 
 
 		 76 aa  101  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  52.5 
 
 		 194 aa  100  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  55.84 
 
 		 175 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  56.41 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  58.67 
 
 		 84 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  53.42 
 
 		 81 aa  93.6  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  48.65 
 
 		 80 aa  88.6  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  47.95 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  47.95 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  44 
 
 		 78 aa  83.6  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  52.7 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  38.36 
 
 		 384 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  47.95 
 
 		 391 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  44.59 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  41.33 
 
 		 402 aa  74.7  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  34.25 
 
 		 383 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  36.11 
 
 		 260 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  43.48 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  39.73 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  41.77 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  46.15 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  40.32 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  39.44 
 
 		 398 aa  62.4  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  39.13 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  39.13 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  35.14 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  44.62 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  44.62 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  39.73 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  44.62 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  46.15 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  44.62 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  44.62 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  44.29 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  43.08 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1784  glutaredoxin and related proteins  38.6 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  43.08 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  43.08 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  41.54 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  39.02 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  40.48 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  36.84 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  44.62 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  38.67 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  36.25 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  30.26 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  30.26 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  40 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0113  glutaredoxin  35.29 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  33.73 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  43.94 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  42.42 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  40 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  30.26 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  42.42 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  40.3 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  42.42 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  35.37 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  39.02 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  39.13 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3897  glutaredoxin family protein  30.26 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3745  glutaredoxin family protein  31.58 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4201  glutaredoxin family protein  30.26 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  39.44 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  30.26 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  30.26 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4003  glutaredoxin family protein  30.26 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4108  glutaredoxin family protein  30.26 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  40 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  38.03 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  37.5 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  36.11 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  40.91 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  40 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  41.54 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  40 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  36.92 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  33.72 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  42.42 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  40 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  33.72 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  38.46 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>