275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0552 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 80 aa  165  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  70 
 
 		 80 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  67.5 
 
 		 80 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  70 
 
 		 80 aa  124  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  61.25 
 
 		 80 aa  117  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  52.56 
 
 		 81 aa  105  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  54.67 
 
 		 84 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  53.33 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  51.95 
 
 		 175 aa  91.3  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  45.95 
 
 		 76 aa  88.2  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  46.05 
 
 		 194 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  52.11 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  45.21 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  50.7 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  44 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  46.75 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  41.89 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  40 
 
 		 384 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  43.84 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  42.67 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  47.3 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  39.73 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  40.28 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  39.02 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  37.5 
 
 		 260 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  33.33 
 
 		 383 aa  62.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  39.47 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  39.76 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  40.79 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  33.78 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  35.44 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  35.53 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  40.54 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  34.67 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  34.15 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  41.79 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  41.43 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  34.67 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  34.67 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  40 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3897  glutaredoxin family protein  34.67 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  34.67 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4201  glutaredoxin family protein  34.67 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  38.67 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4108  glutaredoxin family protein  34.67 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4003  glutaredoxin family protein  34.67 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3745  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  35.44 
 
 		 398 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1784  glutaredoxin and related proteins  34.48 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  38.1 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  38.1 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  35.62 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2230  glutaredoxin  30.86 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381794  normal  0.448349 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  32 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  35.62 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  33.33 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  34.21 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2081  glutaredoxin  41.79 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  38.81 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  38.81 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  32.88 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  29.33 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  33.85 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  42.42 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  37.65 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  32.31 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  36.62 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  31.94 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  41.79 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  27.78 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  33.85 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  34.57 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 84 aa  50.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  34.57 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  28.95 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  39.39 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  33.75 
 
 		 84 aa  50.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0113  glutaredoxin  30.65 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  39.39 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  39.39 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2812  glutaredoxin family protein  32.1 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0889237  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  32.94 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  39.39 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  39.39 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  35.71 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  39.39 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  34.38 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  39.39 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  30.77 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  34.18 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2100  glutaredoxin 3  37.18 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  35.29 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  39.39 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>