226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1082 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  100 
 
 		 116 aa  243  9e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  74.49 
 
 		 116 aa  159  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  94.29 
 
 		 70 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  46.79 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  48.65 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  50.75 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  44.78 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  40.51 
 
 		 191 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  40 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  38.89 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  42.19 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1223  putative glutaredoxin  42.19 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  32.43 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  31.51 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  36 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  38.46 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  35.94 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  46.15 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  28.77 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  37.5 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  33.33 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  27.4 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02143  glutaredoxin  37.5 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  46.81 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1584  glutaredoxin  34.44 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0205634  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  32.86 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  32.86 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  40 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  30.56 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  30.56 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  27.78 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  30 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  36.84 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  30.59 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  37.04 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  37.31 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2412  glutaredoxin family protein  28.99 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00139714  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  45.65 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  38.81 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  30.14 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  30.14 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  35.82 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  52.94 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  32.05 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  34.48 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  35.53 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  35.94 
 
 		 383 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  48.65 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  41.51 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2587  glutaredoxin  27.12 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  32.86 
 
 		 384 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  27.54 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  33.82 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  40 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  27.54 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  28.99 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  28.99 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  37.31 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1126  glutaredoxin 3  39.06 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0880684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  37.68 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  38.81 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  38.81 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  30.14 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  30.14 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  30.14 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  35.9 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  30.43 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  35.53 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  33.8 
 
 		 391 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  32.88 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  34.38 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.82 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  22.88 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  31.25 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  31.25 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  31.76 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  31.25 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2237  hypothetical protein  30.38 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  30.88 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  36.92 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  34.25 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  47.37 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  35.38 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  35.38 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  33.33 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  43.59 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  30 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  30.88 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  29.87 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  28.81 
 
 		 255 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>