87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27570 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 92 aa  189  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  78.75 
 
 		 94 aa  141  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  71.6 
 
 		 85 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  70.37 
 
 		 85 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  78.95 
 
 		 91 aa  130  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  72.15 
 
 		 86 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  66.27 
 
 		 88 aa  124  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  69.33 
 
 		 81 aa  120  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  62.82 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  67.11 
 
 		 79 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  61.84 
 
 		 83 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  60 
 
 		 82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  60 
 
 		 82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  60 
 
 		 82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  59.74 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  63.16 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  62.16 
 
 		 82 aa  104  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  60.98 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  56.63 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  61.84 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  58.67 
 
 		 80 aa  100  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  56.79 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  58.67 
 
 		 80 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  56.58 
 
 		 78 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  57.33 
 
 		 83 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  56.76 
 
 		 84 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  54.79 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  50 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  60.53 
 
 		 84 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  42.67 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  52.78 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  45.33 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  41.89 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  53.45 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  40 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  39.51 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  33.82 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  35.14 
 
 		 83 aa  57  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  31.08 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  28.77 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  52.94 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  37.08 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  34.48 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  34.48 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  39.66 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  34.48 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  32.79 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  39.34 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  35.48 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  36.96 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  42.11 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  36.07 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09790  glutaredoxin-like protein  40.22 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.602612  normal  0.0514825 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  36.07 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  35.59 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  51.61 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  28.38 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  30.38 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  33.93 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  38.71 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  38.71 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  39.66 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  30.51 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0606  glutaredoxin  29.55 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  38.33 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  36.67 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  35.21 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  31.03 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  34.25 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  32.2 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  35.09 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  35.59 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  31.25 
 
 		 101 aa  42.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  29.51 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  29.27 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2077  glutaredoxin  31.65 
 
 		 229 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.622106  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  26.47 
 
 		 86 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  27.03 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  30.51 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  32.73 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1464  glutaredoxin 3  32.69 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  36.17 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  35 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>