112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3740 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 80 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  97.44 
 
 		 80 aa  164  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  72.15 
 
 		 83 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  70.51 
 
 		 82 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  67.09 
 
 		 88 aa  121  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  69.33 
 
 		 86 aa  120  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  71.62 
 
 		 86 aa  116  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  65.38 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  64.1 
 
 		 93 aa  114  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  66.67 
 
 		 78 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  68.92 
 
 		 82 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  68.92 
 
 		 82 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  68.92 
 
 		 82 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  65.33 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  66.67 
 
 		 83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  61.84 
 
 		 79 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  64.47 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  64 
 
 		 83 aa  104  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  56.96 
 
 		 91 aa  103  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  58.67 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  55.7 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  58.97 
 
 		 84 aa  100  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  56.76 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  59.46 
 
 		 82 aa  98.6  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  60.27 
 
 		 79 aa  99  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  56 
 
 		 81 aa  97.8  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  56.76 
 
 		 94 aa  97.1  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  54.67 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  54.67 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  64.47 
 
 		 84 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  44 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  42.31 
 
 		 83 aa  76.6  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  50.85 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  37.97 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  38.57 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  30.67 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  41.38 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  44.29 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  31.17 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  33.9 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  32.47 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09790  glutaredoxin-like protein  45.45 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.602612  normal  0.0514825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  30.56 
 
 		 74 aa  50.4  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  35.53 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  32.43 
 
 		 89 aa  50.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  30.77 
 
 		 84 aa  50.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  34.48 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  40.98 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  36.67 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  31.65 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  35.48 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  35.48 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  34.48 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  28.57 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  34.48 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  45.95 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  38.46 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2077  glutaredoxin  35.8 
 
 		 229 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.622106  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  36.54 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  30.36 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  32.76 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  32.76 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  45.95 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  42.22 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  42.22 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  42.22 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  47.73 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  40.91 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  32.76 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  27.59 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  42.22 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  28.17 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  36.21 
 
 		 78 aa  43.9  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  40.91 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  37.04 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  37.93 
 
 		 85 aa  42.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  31.15 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  35.19 
 
 		 77 aa  42.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  35.19 
 
 		 77 aa  42.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  36.21 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  40.91 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  35.19 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  30.77 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  40 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  36.21 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  51.43 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.93 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  33.33 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  45.95 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  28 
 
 		 83 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 84 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  35.19 
 
 		 85 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  45.24 
 
 		 80 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1126  glutaredoxin 3  37.1 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0880684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  33.33 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  33.33 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>