110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1178 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 94 aa  197  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  78.75 
 
 		 92 aa  141  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  75 
 
 		 86 aa  139  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  68.75 
 
 		 85 aa  126  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  67.5 
 
 		 88 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  67.5 
 
 		 85 aa  125  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  67.47 
 
 		 86 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  66.23 
 
 		 81 aa  122  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  70.67 
 
 		 83 aa  121  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  71.6 
 
 		 87 aa  121  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  67.47 
 
 		 86 aa  120  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  67.11 
 
 		 78 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  67.09 
 
 		 82 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  67.09 
 
 		 82 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  67.09 
 
 		 82 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  65.79 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  65.79 
 
 		 93 aa  114  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  64.94 
 
 		 82 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  65.33 
 
 		 80 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  62.5 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  65.33 
 
 		 80 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  65.79 
 
 		 83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  64 
 
 		 79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  59.74 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  61.84 
 
 		 83 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  65.33 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  58.67 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  56.16 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  54.05 
 
 		 79 aa  94  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  54.67 
 
 		 82 aa  93.6  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  42.11 
 
 		 78 aa  84  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  42.67 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  36.36 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  48.28 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  41.1 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  38.81 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  33.33 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  27.27 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  31.58 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  30.56 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  35 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  27.78 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  37.29 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  32.91 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  36.21 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  34.48 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  33.33 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  34.48 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  38.71 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  42.42 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  32.53 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  32.14 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  35 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  33.93 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  37.7 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  32.76 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  26.76 
 
 		 86 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  28 
 
 		 86 aa  47.8  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  36.84 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  36.84 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  37.93 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  35.42 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  33.87 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1464  glutaredoxin 3  29.82 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  32.73 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  33.33 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  31.75 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  33.87 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  33.33 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  28.57 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  33.93 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  44.12 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  26.79 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  27.4 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  34.48 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  29.17 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  29.69 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  32.73 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  32.73 
 
 		 85 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09790  glutaredoxin-like protein  43.94 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.602612  normal  0.0514825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  45.16 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  31.03 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  27.12 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  26.67 
 
 		 85 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  26.79 
 
 		 85 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  27.63 
 
 		 87 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  26.67 
 
 		 85 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  28.57 
 
 		 85 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  32.14 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  30.3 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  28.38 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  31.48 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  33.82 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  39.58 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  34.55 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  31.03 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  35 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>