49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2229 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  100 
 
 
101 aa  200  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  63.53 
 
 
89 aa  114  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0606  glutaredoxin  37.23 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  38.96 
 
 
83 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  38.96 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  37.35 
 
 
86 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  37.33 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  34.94 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  40 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  34.25 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  38.57 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  35.53 
 
 
80 aa  50.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  40.51 
 
 
122 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  36 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  34.57 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  32.14 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  35.71 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  35.9 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  32.53 
 
 
87 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  33.75 
 
 
82 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  33.75 
 
 
82 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  33.75 
 
 
82 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  34.67 
 
 
83 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  38.71 
 
 
391 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  34.25 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  36.67 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  34.18 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1748  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.05 
 
 
559 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  34.38 
 
 
384 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  33.33 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  30.67 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  35.06 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  33.85 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  31.25 
 
 
92 aa  42.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  38.33 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  30.34 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  32.47 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  32.05 
 
 
84 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 
82 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3268  glutaredoxin  37.04 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  35.59 
 
 
77 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  39.13 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  27.27 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0147  glutaredoxin  29.82 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.500509  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3897  glutaredoxin  32.94 
 
 
162 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.443813  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  29.33 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  32.05 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>