294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1508 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  100 
 
 		 81 aa  171  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  65.43 
 
 		 86 aa  114  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  57.14 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  53.45 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  53.45 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  55.17 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  50.85 
 
 		 80 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  53.7 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  53.7 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  53.7 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  50 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  51.72 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  47.46 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  49.15 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  53.57 
 
 		 93 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  45.31 
 
 		 89 aa  67  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  51.72 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  51.72 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  46.55 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  48.28 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  53.45 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  48.28 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  44.83 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  46.55 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  50 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  57.14 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  50 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  44.83 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  50 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  44.83 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  40.28 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  40.28 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  40.28 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  40.28 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  40.28 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  42.37 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2973  glutaredoxin  50 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.64594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  40.28 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  40.28 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  40.28 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  37.93 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  43.1 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  48.21 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  45.45 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  40.28 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  35.44 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  41.38 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  41.38 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  36 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  37.33 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  38.89 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  38.89 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  38.89 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  38.89 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  37.33 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  37.33 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  42.37 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  35.44 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  42.11 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  37.33 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  39.74 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  36.84 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  45.61 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  43.86 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  39.39 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  35.53 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  34.33 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  36.25 
 
 		 79 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  43.64 
 
 		 85 aa  52.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  36.59 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  37.88 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36.11 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  44.07 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  42.37 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  49.15 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  44.83 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  36.36 
 
 		 80 aa  52  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  35.14 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  35.14 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  36.21 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  42.37 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  36.59 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  39.66 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  37.93 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  35 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  35.14 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  40.68 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  33.78 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  35.9 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  38.03 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  44.07 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  42.37 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  34.67 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  40.54 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  36 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>