98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1515 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
82 aa  173  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  70.51 
 
 
80 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  73.08 
 
 
86 aa  123  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  68.83 
 
 
80 aa  123  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  63.75 
 
 
88 aa  122  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  64.94 
 
 
83 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  66.25 
 
 
86 aa  114  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  64.94 
 
 
86 aa  114  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  64.94 
 
 
94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  63.16 
 
 
79 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  61.04 
 
 
81 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  61.84 
 
 
78 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  60.76 
 
 
91 aa  105  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  62.16 
 
 
92 aa  104  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  59.74 
 
 
93 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  55.13 
 
 
85 aa  101  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  63.01 
 
 
79 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  55.13 
 
 
85 aa  100  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  58.44 
 
 
87 aa  100  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  60.53 
 
 
82 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  60.53 
 
 
82 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  60.53 
 
 
82 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  55.13 
 
 
79 aa  97.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  53.16 
 
 
89 aa  97.1  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  54.67 
 
 
94 aa  96.7  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  47.44 
 
 
78 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  55.13 
 
 
83 aa  94  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  55.84 
 
 
83 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  51.25 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  54.67 
 
 
82 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  60.53 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  39.51 
 
 
83 aa  71.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  39.24 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  41.67 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  36.25 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  34.57 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  48.21 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  37.31 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  31.94 
 
 
74 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09790  glutaredoxin-like protein  44.74 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.602612  normal  0.0514825 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  40.98 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  34.43 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  32.47 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  32.5 
 
 
83 aa  50.1  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  43.1 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  41.51 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  37.5 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  26.92 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  40.68 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  35.09 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  35.09 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  36.84 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  32.1 
 
 
86 aa  47.8  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  36.84 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  31.15 
 
 
85 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  39.71 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  38.98 
 
 
74 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  35.59 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  36.21 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  36.21 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  28.75 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  31.15 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  40.35 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  32.26 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  36.84 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  33.93 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  33.33 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1126  glutaredoxin 3  38.1 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0880684  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  35.48 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  31.15 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  35.48 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  38.71 
 
 
402 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4576  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 
553 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.494559  normal  0.955166 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  29.49 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  32.26 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  34.92 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1342  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.75 
 
 
556 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  32.43 
 
 
101 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  33.33 
 
 
89 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  31.15 
 
 
88 aa  41.2  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  40.74 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  34.48 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  33.96 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  29.33 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  33.87 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  34.48 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  35.09 
 
 
85 aa  40.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  28.07 
 
 
85 aa  40.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  36.51 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6098  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
553 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  26.51 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  37.93 
 
 
249 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  29.51 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  32.76 
 
 
90 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>