194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4233 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 87 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  71.6 
 
 		 94 aa  121  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  66.67 
 
 		 82 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  66.67 
 
 		 82 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  66.67 
 
 		 82 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  70.13 
 
 		 83 aa  117  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  68 
 
 		 83 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  65.33 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  60.98 
 
 		 83 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  59.26 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  57.32 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  59.76 
 
 		 86 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  64.47 
 
 		 80 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  62.03 
 
 		 80 aa  104  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  56.1 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  58.02 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  61.64 
 
 		 93 aa  103  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  60.98 
 
 		 92 aa  103  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  61.33 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  55.95 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  57.89 
 
 		 78 aa  100  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  58.44 
 
 		 82 aa  100  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  53.09 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  55.84 
 
 		 79 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  55.13 
 
 		 81 aa  97.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  60 
 
 		 79 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  53.25 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  48.15 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  49.33 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  57.33 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  38.96 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  40.79 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  41.56 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  44.74 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  50 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  38.89 
 
 		 74 aa  67  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  32.89 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  30.67 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  36.67 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  46.67 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  37.93 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  35 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  37.5 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  36.21 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  40 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  36.21 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  38.33 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  38.96 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  40.35 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  39.66 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  32.1 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  41.67 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  30.77 
 
 		 84 aa  52  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  37.18 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  40.98 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  38.6 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  40.98 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  38.6 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  35.71 
 
 		 83 aa  50.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  42.59 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  41.67 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  41.67 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  41.67 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  40 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  35 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  40 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  36.67 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  35.71 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  34.29 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  33.93 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  35.48 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  32.31 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  38.1 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1464  glutaredoxin 3  33.93 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  46.55 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  33.87 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  34.43 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  40.35 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  32.76 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  32.53 
 
 		 101 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  38.18 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  35.53 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  33.87 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  37.93 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  33.87 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  38.18 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  28.57 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02081  glutaredoxin  30.65 
 
 		 84 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  34.48 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  45.83 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  30 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  33.87 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  33.87 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  28.12 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  33.9 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  31.67 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>