More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0556 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  100 
 
 
77 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  77.03 
 
 
81 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  54.55 
 
 
80 aa  94.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  49.32 
 
 
194 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  47.95 
 
 
80 aa  78.2  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  45.21 
 
 
81 aa  76.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 
84 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 
84 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  42.47 
 
 
75 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  42.47 
 
 
75 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 
80 aa  74.3  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  42.67 
 
 
384 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  46.67 
 
 
402 aa  72.8  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  45.21 
 
 
80 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  46.27 
 
 
85 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  47.22 
 
 
76 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  42.67 
 
 
391 aa  70.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  44 
 
 
383 aa  70.5  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  40.79 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  39.73 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  39.73 
 
 
80 aa  68.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  39.47 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  39.47 
 
 
78 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  38.16 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3745  glutaredoxin family protein  39.47 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  39.73 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  39.47 
 
 
78 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4003  glutaredoxin family protein  39.47 
 
 
78 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  39.47 
 
 
78 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4108  glutaredoxin family protein  39.47 
 
 
78 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  37.84 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  47.76 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  38.67 
 
 
78 aa  63.9  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  39.47 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3897  glutaredoxin family protein  38.16 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4201  glutaredoxin family protein  38.16 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  41.79 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  37.18 
 
 
84 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  35.82 
 
 
82 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  35.82 
 
 
82 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  35.82 
 
 
82 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  34.21 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  38.36 
 
 
260 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  36.84 
 
 
398 aa  59.3  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  36 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  41.18 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  42.65 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  44.44 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  35.82 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  40.62 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  35.82 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  35.82 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  35.82 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  35.82 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  42.86 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  37.5 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  32.43 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  39.71 
 
 
85 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  33.75 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  39.71 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  43.06 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  34.21 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  42.65 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  42.65 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  41.18 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  41.18 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  42.65 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  42.25 
 
 
87 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  37.5 
 
 
249 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4334  glutaredoxin  38.1 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  39.71 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  36.92 
 
 
102 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  41.18 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  35.82 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  35.82 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  35.82 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  42.65 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  35.82 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  35.82 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  39.71 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  34.33 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  35.82 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  42.65 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  39.71 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  35.82 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  35.82 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  35.82 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  42.65 
 
 
85 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  37.31 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  37.31 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  41.18 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  38.81 
 
 
84 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  34.33 
 
 
82 aa  54.3  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  37.31 
 
 
84 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  37.31 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  33.85 
 
 
101 aa  54.7  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  33.85 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  42.65 
 
 
85 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  36.76 
 
 
85 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  40.3 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>