98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3497 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
94 aa  195  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  75.32 
 
 
79 aa  125  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  69.14 
 
 
83 aa  124  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  58.54 
 
 
86 aa  114  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  67.11 
 
 
78 aa  114  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  68 
 
 
82 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  68 
 
 
82 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  68 
 
 
82 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  64.2 
 
 
83 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  66.67 
 
 
81 aa  110  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  67.53 
 
 
84 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  61.73 
 
 
86 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  59.74 
 
 
94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  55.56 
 
 
88 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  59.74 
 
 
92 aa  104  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  59.76 
 
 
93 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  50.62 
 
 
86 aa  97.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  56.76 
 
 
80 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  56.76 
 
 
80 aa  96.7  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  54.67 
 
 
82 aa  96.7  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  55 
 
 
85 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  56.58 
 
 
91 aa  95.9  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  62.16 
 
 
82 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  53.33 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  52.5 
 
 
85 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  50.67 
 
 
83 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  48.15 
 
 
87 aa  90.5  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  53.42 
 
 
79 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  48.65 
 
 
79 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  49.38 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  40 
 
 
78 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  42.67 
 
 
83 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  45.21 
 
 
86 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  40.54 
 
 
85 aa  63.5  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  50 
 
 
81 aa  62.8  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  33.33 
 
 
81 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  39.62 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  36.71 
 
 
86 aa  53.9  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  32.43 
 
 
84 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  37.04 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  35.59 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  32.2 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  38.98 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  34.48 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  32.2 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  36.21 
 
 
85 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  34.48 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  35.71 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2077  glutaredoxin  37.88 
 
 
229 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.622106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  38.18 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  38.18 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  38.18 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0096  glutaredoxin  32.43 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  29.73 
 
 
86 aa  47  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2760  glutaredoxin  25 
 
 
74 aa  47.4  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  35.21 
 
 
100 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  40 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  29.63 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  35.29 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  32.73 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  35.59 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  40 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  32.14 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  37.5 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  30.59 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  35.42 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0606  glutaredoxin  29.07 
 
 
97 aa  42.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  30.16 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  38.3 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  35 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  36.21 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  35.59 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  34.48 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  30.51 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  31.67 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  29.82 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  29.82 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  35.59 
 
 
91 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  50 
 
 
70 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 
88 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  27.03 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  36.84 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  35.59 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  28.75 
 
 
85 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  30.19 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  30.19 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1342  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.87 
 
 
556 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  30 
 
 
88 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  33.77 
 
 
194 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  29.82 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6098  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.48 
 
 
553 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  34.55 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  32.2 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2229  glutaredoxin  29.33 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  34.55 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  35 
 
 
80 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  34.21 
 
 
85 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>