137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4712 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 105 aa  214  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  62.65 
 
 		 100 aa  104  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2077  glutaredoxin  52.56 
 
 		 229 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.622106  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09790  glutaredoxin-like protein  64.06 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.602612  normal  0.0514825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  41.98 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  44.74 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  43.42 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  34.57 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  42.86 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  44 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  44 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  44 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  44.29 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  39.51 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  42.47 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  41.43 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  38.27 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  44.12 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  44.29 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  38.96 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  31.65 
 
 		 247 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  37.04 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  34.29 
 
 		 243 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  35.71 
 
 		 242 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  38.67 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  34.29 
 
 		 243 aa  52  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  34.29 
 
 		 243 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  35.71 
 
 		 242 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  38.16 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  38.16 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  32.86 
 
 		 243 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  40 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  41.67 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  26.67 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  42.42 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  40 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  42.86 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  37.08 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  37.1 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  40.68 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  31.43 
 
 		 238 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  37.14 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  34.18 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  29.11 
 
 		 243 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  35.44 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  38.57 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  38.57 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  34.48 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  36.07 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  28.57 
 
 		 247 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  28.57 
 
 		 247 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  30.77 
 
 		 247 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  32.76 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  39.71 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  39.68 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  34.48 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  33.33 
 
 		 249 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  32.14 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  31.15 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  32.79 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  38.33 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  30.77 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  34.43 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  30 
 
 		 243 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  32.2 
 
 		 85 aa  42.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  27.14 
 
 		 243 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  31.15 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  40.35 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  31.75 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  31.15 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  30.16 
 
 		 105 aa  42.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  31.75 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  30 
 
 		 243 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43497  glutaredoxin  28.4 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00275493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  44.3 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4389  glutaredoxin  29.31 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  32.2 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  31.4 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  25 
 
 		 255 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  32.2 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  29.03 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  41.67 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.75 
 
 		 459 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0542  glutaredoxin  43.9 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.695233  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  36.84 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  36.84 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  36.84 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  36.84 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  36.84 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  31.08 
 
 		 251 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  34.43 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  32.79 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  32.79 
 
 		 88 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  31.67 
 
 		 87 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  32.79 
 
 		 84 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  40.98 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  33.93 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>