163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0976 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  100 
 
 		 105 aa  221  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  46.59 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  49.32 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  47.22 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  44.44 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  41.18 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  40.45 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  40.26 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  42.31 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  40.24 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  40.74 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  40.74 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  40.74 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  37.33 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  39.51 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  43.9 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  39.02 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  35.44 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  38.27 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  37.8 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  34.02 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  39.51 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  36.59 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  37.04 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  38.27 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  37.8 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  39.02 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  38.27 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  38.27 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  40.74 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  38.27 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  42.59 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  39.02 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  39.02 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  35 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  38.82 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  37.35 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  38.75 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  36.84 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  38.75 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  33.75 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  34.57 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  35.37 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  34.18 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  33.33 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  34.62 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 82 aa  50.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  30.86 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02081  glutaredoxin  37.7 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  33.9 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  32.2 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  32.2 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  32.84 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  32.2 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  39.51 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  33.82 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  32.2 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  32.2 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  31.58 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  31.15 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  31.15 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  32.05 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  33.78 
 
 		 243 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  32.2 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  33.72 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  27.69 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  32.79 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  33.33 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  31.51 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  30.3 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001434  glutaredoxin  31.58 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000262523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  25.88 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  29.27 
 
 		 384 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1712  glutaredoxin  30.77 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266402  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  31.15 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  32.79 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  29.11 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  30 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  34.15 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1529  putative glutaredoxin  38.1 
 
 		 187 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.164431  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06292  hypothetical protein  31.17 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  29.11 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  28.75 
 
 		 398 aa  43.9  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  33.33 
 
 		 402 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  24.72 
 
 		 442 aa  43.5  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  29.11 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  29.11 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  30.16 
 
 		 105 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>