63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1594 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  100 
 
 		 118 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  68.64 
 
 		 118 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  71.19 
 
 		 118 aa  179  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  70.34 
 
 		 118 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  70.34 
 
 		 118 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  66.95 
 
 		 118 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  70.34 
 
 		 118 aa  176  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  67.8 
 
 		 118 aa  175  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  68.64 
 
 		 118 aa  174  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  69.49 
 
 		 118 aa  173  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  68.64 
 
 		 118 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  68.64 
 
 		 118 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  66.95 
 
 		 118 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  68.38 
 
 		 118 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  68.38 
 
 		 118 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  59.32 
 
 		 118 aa  168  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  54.62 
 
 		 119 aa  140  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  50.42 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  50 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  50 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  45.76 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  49.57 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  50.41 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  50 
 
 		 123 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  49.11 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  49.11 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  51.72 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  49.14 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  48.28 
 
 		 123 aa  116  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  51.28 
 
 		 130 aa  114  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  41.32 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  45.6 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  47.01 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  41.88 
 
 		 123 aa  110  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  44.54 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  49.57 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  44.54 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  47.01 
 
 		 130 aa  100  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  44.83 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  45.16 
 
 		 115 aa  87.8  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  45.12 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  40.24 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  40.74 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  37.18 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  42.67 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  35.53 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  33.77 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  36.36 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  29.27 
 
 		 309 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  29.11 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.18 
 
 		 284 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  33.73 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  25.32 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.55 
 
 		 252 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  34.67 
 
 		 215 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  32.43 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  32.43 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  32.43 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  32.43 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  34.25 
 
 		 221 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  33.33 
 
 		 914 aa  40.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  31.08 
 
 		 215 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>