155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1387 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  100 
 
 		 77 aa  156  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  49.32 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  41.77 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  42.11 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  40.74 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  47.83 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  41.89 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  34.21 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  43.9 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  34.57 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  37.66 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  39.73 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  38.81 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  37.04 
 
 		 402 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  35 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  34.72 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  34.72 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  31.58 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  34.21 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  35.53 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  34.72 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  37.31 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  33.33 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  31.17 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  32.84 
 
 		 398 aa  50.8  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  34.72 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  34.72 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  29.73 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  31.17 
 
 		 123 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  35.14 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  35.06 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  26.03 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  31.58 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  33.33 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  34.29 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  27.69 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0113  glutaredoxin  32.39 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  29.49 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  26.58 
 
 		 383 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  35.29 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  30.26 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  31.51 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  36.11 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  34.72 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  34.72 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  34.72 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  29.58 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  23.88 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4334  glutaredoxin  21.33 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  24.66 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  24.66 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  24.66 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  30.77 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  24.66 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  24.66 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  39.44 
 
 		 218 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  31.17 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  21.79 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  24.66 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  28.85 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  21.79 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.88 
 
 		 284 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  24.29 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  25 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  32.88 
 
 		 87 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  32.47 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2174  glutaredoxin family protein  20.27 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  39.73 
 
 		 226 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  28.36 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  27.63 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_006686  CND01340  glutathione transferase, putative  27.14 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  27.14 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  25.64 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  24.29 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  17.39 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  27.14 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  21.43 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  27.78 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.77 
 
 		 459 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  25.64 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  28.57 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  32.76 
 
 		 442 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  17.39 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  27.78 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  21.43 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  36.62 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  26.87 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  17.39 
 
 		 83 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  18.84 
 
 		 82 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  17.39 
 
 		 83 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  23.29 
 
 		 86 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  17.39 
 
 		 83 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  17.39 
 
 		 83 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  18.06 
 
 		 82 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  18.84 
 
 		 82 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  25.45 
 
 		 194 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  18.84 
 
 		 82 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  20.83 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  27.14 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>