138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2423 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  100 
 
 
85 aa  170  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  70.24 
 
 
86 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  76.54 
 
 
82 aa  127  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  72.62 
 
 
84 aa  124  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  66.27 
 
 
84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  52.56 
 
 
86 aa  86.7  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  52.56 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  53.57 
 
 
86 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  51.22 
 
 
94 aa  83.6  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  46.15 
 
 
78 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  48.68 
 
 
79 aa  75.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0048  glutaredoxin  49.38 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1712  glutaredoxin  48.78 
 
 
114 aa  73.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266402  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  44.44 
 
 
87 aa  73.6  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  44.87 
 
 
317 aa  62  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  39.76 
 
 
309 aa  61.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  32.1 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  30.77 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  31.71 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  31.25 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  32.91 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  28.57 
 
 
123 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  41.38 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  28.57 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  29.49 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  31.65 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  31.25 
 
 
130 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  31.25 
 
 
118 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  30.38 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  34.57 
 
 
383 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  28.75 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  34.62 
 
 
398 aa  50.4  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  32.91 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  31.65 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.91 
 
 
284 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  30.26 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  30.38 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  30.38 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  30.49 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  30.49 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  29.11 
 
 
123 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  28.75 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  29.11 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  35 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  30.86 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  30.86 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  30.86 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  29.11 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  29.11 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  29.11 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  36.25 
 
 
342 aa  47.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  27.85 
 
 
123 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  28.05 
 
 
130 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  24.39 
 
 
123 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  34.57 
 
 
225 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  26.58 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  27.85 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  37.33 
 
 
241 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  30.59 
 
 
384 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  28.75 
 
 
148 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  33.93 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  27.5 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  27.85 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  36.84 
 
 
247 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  33.93 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1608  glutaredoxin  36.36 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0528934  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  26.25 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  29.63 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  30.38 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  32.43 
 
 
247 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  38.89 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2863  putative lignin beta-etherase  36.47 
 
 
222 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  28.75 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  33.33 
 
 
391 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  31.17 
 
 
82 aa  45.1  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  36 
 
 
222 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  35.44 
 
 
217 aa  44.3  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3239  hypothetical protein  36.78 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4017  glutathione S-transferase-like  37.68 
 
 
232 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  37.04 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  25.32 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  33.78 
 
 
87 aa  43.5  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  36.71 
 
 
264 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  33.33 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  26.25 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01261  putative glutathione S-transferase  34.67 
 
 
241 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  26.47 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  35.14 
 
 
243 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  36.11 
 
 
241 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  35.14 
 
 
243 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  35.14 
 
 
243 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  35.44 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  32.89 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  28.57 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  32.14 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  40.58 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  27.91 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2357  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.88 
 
 
238 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396368  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>