49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0406 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  100 
 
 		 86 aa  174  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0048  glutaredoxin  77.38 
 
 		 105 aa  143  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  70.59 
 
 		 87 aa  132  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1712  glutaredoxin  71.95 
 
 		 114 aa  133  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266402  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  68.29 
 
 		 94 aa  124  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  60 
 
 		 86 aa  103  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  62.34 
 
 		 78 aa  103  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  61.04 
 
 		 78 aa  102  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  53.42 
 
 		 79 aa  90.1  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  53.57 
 
 		 85 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  51.28 
 
 		 84 aa  85.5  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  48.75 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  47.62 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  47.5 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  40 
 
 		 342 aa  57.4  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  37.97 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  32.5 
 
 		 914 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  35.9 
 
 		 317 aa  52.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.59 
 
 		 284 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  31.65 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  32.47 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  35.9 
 
 		 241 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  30.86 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  31.65 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  29.11 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 264 aa  43.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  30.38 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  31.25 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1566  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3080  glutathione S-transferase-like  34.25 
 
 		 223 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0113  putative glutathione S-transferase  32.88 
 
 		 241 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  35 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  31.65 
 
 		 82 aa  42  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  30.86 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  37.66 
 
 		 200 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  30.86 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  30.86 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01261  putative glutathione S-transferase  32.88 
 
 		 241 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  28.95 
 
 		 239 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  33.73 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  25.32 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  28.74 
 
 		 226 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 		 263 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 		 263 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  29.11 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  26.44 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  29.87 
 
 		 119 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>