81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0816 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  100 
 
 
119 aa  248  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  65.25 
 
 
119 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  64.41 
 
 
119 aa  169  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  57.5 
 
 
121 aa  149  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  51.69 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  52.54 
 
 
123 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  54.24 
 
 
118 aa  140  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  50.85 
 
 
123 aa  140  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  52.54 
 
 
118 aa  140  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  55.08 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  51.69 
 
 
118 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  55.08 
 
 
118 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  51.69 
 
 
118 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  50.85 
 
 
118 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  50.85 
 
 
118 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  50.85 
 
 
118 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  50.85 
 
 
118 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  50.85 
 
 
123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  50.85 
 
 
123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  50.85 
 
 
123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  50 
 
 
123 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  50 
 
 
123 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  49.15 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  49.15 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  49.15 
 
 
123 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  49.15 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  49.15 
 
 
118 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  49.15 
 
 
121 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  49.58 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  50.86 
 
 
124 aa  124  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  45.76 
 
 
118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  45.76 
 
 
118 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  48.31 
 
 
123 aa  120  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  47.32 
 
 
130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  43.97 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  44.54 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  40.34 
 
 
130 aa  106  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  47.87 
 
 
115 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  40.34 
 
 
130 aa  101  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  45.45 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  36.9 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  32.76 
 
 
309 aa  57.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  38.67 
 
 
78 aa  57  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  41.03 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  32.5 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  40.51 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  36.99 
 
 
148 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  33.33 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  28.75 
 
 
85 aa  50.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  30.86 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  38.67 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  31.33 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  32.91 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  28.75 
 
 
84 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.47 
 
 
284 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  33.75 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  30 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2101  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 
242 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  31.17 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  28.95 
 
 
914 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  32.43 
 
 
215 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  31.08 
 
 
215 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  32.88 
 
 
215 aa  41.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  29.73 
 
 
215 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  29.73 
 
 
215 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  29.73 
 
 
215 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  29.73 
 
 
215 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1801  glutaredoxin 2  32.43 
 
 
215 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  28.38 
 
 
215 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.224556 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  28.38 
 
 
215 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  28.38 
 
 
215 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  28.38 
 
 
215 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  28.38 
 
 
215 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  28.38 
 
 
215 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  28.38 
 
 
215 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  28.38 
 
 
215 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  28.38 
 
 
215 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  28.38 
 
 
215 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3239  hypothetical protein  30.59 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  29.87 
 
 
86 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>