96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12420 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
82 aa  166  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  48.68 
 
 
80 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  41.03 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  40.96 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  40.96 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  42.31 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  42.31 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  47.83 
 
 
77 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  44.16 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  40.26 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  41.56 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  49.32 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  41.56 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  41.56 
 
 
118 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  41.56 
 
 
118 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  40.85 
 
 
78 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  41.77 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  44.74 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  41.77 
 
 
124 aa  57.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  43.04 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  41.03 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  37.5 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2075  glutaredoxin  45.16 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2449  hypothetical protein  45.16 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  37.33 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  38.27 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  36.36 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  37.18 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  36.99 
 
 
118 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  35.44 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  33.75 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  44 
 
 
115 aa  52.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  36.51 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  35.38 
 
 
88 aa  52  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  37.66 
 
 
121 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  34.33 
 
 
243 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  38.75 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  34.33 
 
 
243 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  32.47 
 
 
118 aa  50.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  32.39 
 
 
243 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  41.18 
 
 
130 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  36.14 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  32.39 
 
 
243 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  34.62 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  38.16 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  29.58 
 
 
243 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  29.58 
 
 
243 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  29.58 
 
 
243 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  34.62 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  40.54 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  35.9 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  35.9 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  35.9 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  32.53 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  37.5 
 
 
87 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  30.99 
 
 
243 aa  47.4  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  28.77 
 
 
242 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  31.71 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  28.77 
 
 
247 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  30.99 
 
 
242 aa  46.2  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  33.75 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  33.33 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  36 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  37.33 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  28.77 
 
 
242 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0113  glutaredoxin  31.58 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  34.21 
 
 
251 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  38.55 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  30.49 
 
 
123 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  31.17 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  31.25 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  27.59 
 
 
245 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.18 
 
 
284 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  30 
 
 
247 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  25.68 
 
 
249 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  35.06 
 
 
398 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  33.78 
 
 
245 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  28.57 
 
 
238 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  37.04 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  32.05 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  27.54 
 
 
247 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  33.33 
 
 
130 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  38.16 
 
 
86 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  34.62 
 
 
84 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  30.88 
 
 
249 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  31.65 
 
 
86 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  30.88 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  34.25 
 
 
309 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5453  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.71 
 
 
217 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0448477 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  31.58 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  31.08 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  37.8 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2412  glutaredoxin family protein  32.86 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00139714  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  31.75 
 
 
246 aa  40.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  32.35 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  32.76 
 
 
76 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>