51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2107 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  100 
 
 
94 aa  192  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  75.61 
 
 
87 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0048  glutaredoxin  67.74 
 
 
105 aa  131  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1712  glutaredoxin  62.89 
 
 
114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266402  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  68.29 
 
 
86 aa  124  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  63.16 
 
 
86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  62.34 
 
 
78 aa  106  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  59.74 
 
 
78 aa  104  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  52.63 
 
 
79 aa  92.8  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  51.9 
 
 
84 aa  87.4  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  46.25 
 
 
86 aa  84  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  48.1 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  51.22 
 
 
85 aa  83.6  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  51.25 
 
 
82 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  35.29 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  34.83 
 
 
317 aa  53.9  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.18 
 
 
284 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  32.5 
 
 
309 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  33.75 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  34.88 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  30.12 
 
 
914 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  34.88 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45400  predicted protein  32.14 
 
 
342 aa  46.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  33.33 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  34.88 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  35.14 
 
 
241 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  33.75 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  37.8 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  36 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  34.62 
 
 
241 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  29.9 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  30.77 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  30.77 
 
 
225 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  30.67 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  29.11 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0113  putative glutathione S-transferase  32.43 
 
 
241 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  34.62 
 
 
264 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2685  glutathione S-transferase-like protein  37.5 
 
 
236 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  31.25 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  29.27 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  29.27 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  30.49 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  31.25 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  28.21 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  27.5 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01261  putative glutathione S-transferase  32.43 
 
 
241 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1608  glutaredoxin  38.16 
 
 
81 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0528934  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  30.95 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  32 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  28.95 
 
 
398 aa  40  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.226157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>